論文の概要: A Multimodal Transformer: Fusing Clinical Notes with Structured EHR Data for Interpretable In-Hospital Mortality Prediction

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2208.10240v2
• Date: Tue, 9 May 2023 16:54:31 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2023-05-10 16:33:47.746217
• Title: A Multimodal Transformer: Fusing Clinical Notes with Structured EHR Data for Interpretable In-Hospital Mortality Prediction
• Title（参考訳）: マルチモーダル変圧器:構造付きHRデータを用いた臨床ノートの解釈型院内死亡予測
• Authors: Weimin Lyu, Xinyu Dong, Rachel Wong, Songzhu Zheng, Kayley Abell-Hart, Fusheng Wang, Chao Chen
• Abstract要約: 臨床ノートと構造化HRデータを融合し,院内死亡率の予測に役立てる新しいマルチモーダルトランスフォーマーを提案する。 そこで本研究では,臨床ノートにおいて重要な単語を選択するための統合的勾配(IG)手法を提案する。 また,臨床 BERT における領域適応型事前訓練とタスク適応型微調整の重要性についても検討した。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 8.625186194860696
• License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
• Abstract: Deep-learning-based clinical decision support using structured electronic health records (EHR) has been an active research area for predicting risks of mortality and diseases. Meanwhile, large amounts of narrative clinical notes provide complementary information, but are often not integrated into predictive models. In this paper, we provide a novel multimodal transformer to fuse clinical notes and structured EHR data for better prediction of in-hospital mortality. To improve interpretability, we propose an integrated gradients (IG) method to select important words in clinical notes and discover the critical structured EHR features with Shapley values. These important words and clinical features are visualized to assist with interpretation of the prediction outcomes. We also investigate the significance of domain adaptive pretraining and task adaptive fine-tuning on the Clinical BERT, which is used to learn the representations of clinical notes. Experiments demonstrated that our model outperforms other methods (AUCPR: 0.538, AUCROC: 0.877, F1:0.490).
• Abstract（参考訳）: 構造化電子健康記録(EHR)を用いた深層学習に基づく臨床意思決定支援は、死亡率と疾患のリスクを予測するための活発な研究領域である。 一方、大量の物語的臨床ノートは相補的な情報を提供するが、しばしば予測モデルに統合されない。 本稿では, 臨床ノートを融合するマルチモーダルトランスフォーマーとehrデータを構造化し, 病院内死亡率の予測を改善する。 そこで本研究では,臨床ノートから重要な単語を抽出し,シャプリー値による重要な構造的EHR特徴を発見するための統合的勾配(IG)手法を提案する。 これらの重要な単語と臨床特徴を可視化し、予測結果の解釈を支援する。 また,臨床ノートの表現を学習するための領域適応型事前訓練とタスク適応型微調整の重要性についても検討した。 aucpr: 0.538, aucroc: 0.877, f1:0.490)。

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