論文の概要: Deep Learning for Taxol Exposure Analysis: A New Cell Image Dataset and Attention-Based Baseline Model
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.14349v1
- Date: Wed, 20 Aug 2025 01:41:26 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-08-21 16:52:41.306614
- Title: Deep Learning for Taxol Exposure Analysis: A New Cell Image Dataset and Attention-Based Baseline Model
- Title(参考訳): タキソール曝露分析のための深層学習:新しいセルイメージデータセットと注意ベースラインモデル
- Authors: Sean Fletcher, Gabby Scott, Douglas Currie, Xin Zhang, Yuqi Song, Bruce MacLeod,
- Abstract要約: 細胞レベルでの薬剤であるタキソールの効果のモニタリングは臨床評価と生医学研究の両方において重要である。
深層学習のアプローチは、医学的および生物学的画像解析において大きな可能性を秘めている。
現在、タキソール曝露に対する細胞反応の自動形態学的解析のための公開データセットは存在しない。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.755209318470883
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Monitoring the effects of the chemotherapeutic agent Taxol at the cellular level is critical for both clinical evaluation and biomedical research. However, existing detection methods require specialized equipment, skilled personnel, and extensive sample preparation, making them expensive, labor-intensive, and unsuitable for high-throughput or real-time analysis. Deep learning approaches have shown great promise in medical and biological image analysis, enabling automated, high-throughput assessment of cellular morphology. Yet, no publicly available dataset currently exists for automated morphological analysis of cellular responses to Taxol exposure. To address this gap, we introduce a new microscopy image dataset capturing C6 glioma cells treated with varying concentrations of Taxol. To provide an effective solution for Taxol concentration classification and establish a benchmark for future studies on this dataset, we propose a baseline model named ResAttention-KNN, which combines a ResNet-50 with Convolutional Block Attention Modules and uses a k-Nearest Neighbors classifier in the learned embedding space. This model integrates attention-based refinement and non-parametric classification to enhance robustness and interpretability. Both the dataset and implementation are publicly released to support reproducibility and facilitate future research in vision-based biomedical analysis.
- Abstract(参考訳): 細胞レベルでの薬剤であるタキソールの効果のモニタリングは臨床評価と生医学研究の両方において重要である。
しかし、既存の検出方法は、特殊な装置、熟練した人員、広範囲なサンプル準備を必要としており、高価で労働集約的で、高スループットやリアルタイム分析には適さない。
深層学習アプローチは、医学的および生物学的画像解析において大きな可能性を示しており、細胞形態の自動化された高スループット評価を可能にしている。
しかし、タキソール曝露に対する細胞反応の自動形態学的解析のために現在利用可能なデータセットは存在しない。
このギャップに対処するために,タキソール濃度の異なるC6グリオーマ細胞を捉えた新しい顕微鏡画像データセットを導入する。
そこで本研究では,ResNet-50とConvolutional Block Attention Modulesを組み合わせたベースラインモデルを提案する。
このモデルは、注意に基づく洗練と非パラメトリック分類を統合し、堅牢性と解釈可能性を高める。
データセットと実装の両方が公開され、再現性をサポートし、視覚ベースの生体医学分析における将来の研究を促進する。
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