論文の概要: GUI Based Fuzzy Logic and Spatial Statistics for Unsupervised Microscopy Segmentation

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.15979v1
• Date: Thu, 21 Aug 2025 21:44:53 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2025-08-25 16:42:36.195552
• Title: GUI Based Fuzzy Logic and Spatial Statistics for Unsupervised Microscopy Segmentation
• Title（参考訳）: 教師なし顕微鏡分割のためのGUIに基づくファジィ論理と空間統計
• Authors: Surajit Das, Pavel Zun,
• Abstract要約: 局所平均からの空間標準偏差(SSDLM)、ファジィ論理、調整されたヴァリグラム、モランのI、累積2乗強度シフト(CSSNI)を組み合わせた最初の教師なしセグメンテーションフレームワークを提案する。 ディープラーニングモデルとは異なり、私たちのアプローチではアノテーションや再トレーニングは必要ありません。 本手法は,IoUが最大48%増加し,統計的に優位性を示すことにより,セグメンテーション性能を著しく向上させる。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 3.5092739016434567
• License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
• Abstract: Brightfield microscopy imaging of unstained live cells remains a persistent challenge due to low contrast, temporal changes in specimen phenotypes, irregular illumination, and the absence of training labels. While deep learning (DL) methods (e.g., Cellpose 3.0) achieve state-of-the-art (SOTA) performance, they require extensive labeled data and heavy computational resources, and they often fail under uneven illumination. We present the first unsupervised segmentation framework combining spatial standard deviation from local mean (SSDLM), fuzzy logic, adjusted variograms, Moran's I, and cumulative squared shift of nodal intensity (CSSNI) to address these limitations. Unlike deep learning models, our approach requires no annotations or retraining and operates through a user-friendly GUI tailored for non-programming users. The robustness and generality were validated on three datasets, including cross-domain data. We benchmark our method against 2023--2024 SOTA models, including Cellpose 3.0 and StarDist, using a dataset of unstained myoblast images. Our method achieves a significant improvement in segmentation performance, with an IoU increase of up to 48\% and statistically validated superiority ($p < 0.01$, Wilcoxon signed-rank test). Expert evaluation from two biologists further supports the segmentation quality (Cohen's $\kappa > 0.75$). The proposed algorithm is lightweight, interpretable, and computationally efficient, offering a practical and effective alternative for cell segmentation in label-free microscopy. The code, the dataset, and the results are available for reproducibility*.
• Abstract（参考訳）: 低コントラスト、検体表現型の変化、不規則な照明、トレーニングラベルの欠如などにより、無宿の生きた細胞のブライトフィールド顕微鏡画像撮影はいまだに永続的な課題である。 ディープラーニング(DL)手法(例えば、Cellpose 3.0)は最先端(SOTA)のパフォーマンスを達成するが、ラベル付きデータと重い計算資源が必要であり、不均一な照明の下で失敗することが多い。 本稿では,局所平均値(SSDLM)からの空間標準偏差,ファジィ論理,ヴァリグラムの調整,モランIの累積2乗シフト(CSSNI)を併用した最初の教師なしセグメンテーションフレームワークを提案する。 ディープラーニングモデルとは異なり、私たちのアプローチではアノテーションや再トレーニングは必要ありません。 堅牢性と汎用性は、ドメイン間データを含む3つのデータセットで検証された。 筋芽細胞画像のデータセットを用いて,Cellpose 3.0やStarDistを含む2023--2024 SOTAモデルに対して,本手法をベンチマークした。 提案手法は,IoUが最大48 %増加し,統計的に優位性(p < 0.01$, Wilcoxon sign-rank test)が得られたことにより,セグメンテーション性能が著しく向上する。 2人の生物学者による専門家による評価は、セグメンテーションの品質をさらに支持している(コーエンの$\kappa > 0.75$)。 提案アルゴリズムは軽量で、解釈可能で、計算効率が良く、ラベルなし顕微鏡における細胞セグメンテーションの実用的で効果的な代替手段を提供する。 コード、データセット、結果は再現性*で利用可能です。

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