論文の概要: Understanding Benefits and Pitfalls of Current Methods for the Segmentation of Undersampled MRI Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.18975v1
- Date: Tue, 26 Aug 2025 12:22:06 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-08-27 17:42:38.834758
- Title: Understanding Benefits and Pitfalls of Current Methods for the Segmentation of Undersampled MRI Data
- Title(参考訳): アンダーサンプルMRIデータのセグメンテーションにおける現在の方法の利点と落とし穴の理解
- Authors: Jan Nikolas Morshuis, Matthias Hein, Christian F. Baumgartner,
- Abstract要約: 本稿では,7つのアプローチを比較したアンダーサンプルMRIデータのセグメンテーションのための,最初の統一されたベンチマークを提供する。
提案手法は,マルチコイルk空間データを含む2つのMRIデータセットと,人間による注釈付きセグメンテーショングラウンドトラスを用いて検証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 13.289624718860539
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: MR imaging is a valuable diagnostic tool allowing to non-invasively visualize patient anatomy and pathology with high soft-tissue contrast. However, MRI acquisition is typically time-consuming, leading to patient discomfort and increased costs to the healthcare system. Recent years have seen substantial research effort into the development of methods that allow for accelerated MRI acquisition while still obtaining a reconstruction that appears similar to the fully-sampled MR image. However, for many applications a perfectly reconstructed MR image may not be necessary, particularly, when the primary goal is a downstream task such as segmentation. This has led to growing interest in methods that aim to perform segmentation directly on accelerated MRI data. Despite recent advances, existing methods have largely been developed in isolation, without direct comparison to one another, often using separate or private datasets, and lacking unified evaluation standards. To date, no high-quality, comprehensive comparison of these methods exists, and the optimal strategy for segmenting accelerated MR data remains unknown. This paper provides the first unified benchmark for the segmentation of undersampled MRI data comparing 7 approaches. A particular focus is placed on comparing \textit{one-stage approaches}, that combine reconstruction and segmentation into a unified model, with \textit{two-stage approaches}, that utilize established MRI reconstruction methods followed by a segmentation network. We test these methods on two MRI datasets that include multi-coil k-space data as well as a human-annotated segmentation ground-truth. We find that simple two-stage methods that consider data-consistency lead to the best segmentation scores, surpassing complex specialized methods that are developed specifically for this task.
- Abstract(参考訳): MR画像は、患者解剖学や病理学を非侵襲的に可視化し、高いソフト・コントラストで診断する貴重なツールである。
しかし、MRIの取得は一般的に時間を要するため、患者の不快感と医療システムに対するコストの増加につながる。
近年,MRI画像の完全サンプル化に類似した再現性を確保しつつ,MRIの獲得を加速させる手法の開発に多大な研究努力が続けられている。
しかし、多くのアプリケーションでは、特にセグメンテーションのような下流タスクが第一の目的である場合、完全に再構成されたMR画像は必要ないかもしれない。
これにより、加速MRIデータ上でセグメント化を直接実行することを目的とした手法への関心が高まっている。
最近の進歩にもかかわらず、既存の手法は独立して開発され、直接比較することなく、しばしば独立したデータセットやプライベートデータセットを使用し、統一された評価基準が欠如している。
現在、これらの手法の高品質で包括的な比較は行われておらず、高速化されたMRデータのセグメンテーションのための最適戦略はいまだに不明である。
本稿では,7つのアプローチを比較したアンダーサンプルMRIデータのセグメンテーションのための,最初の統一されたベンチマークを提供する。
特に、再構成とセグメンテーションを統一モデルに組み合わせた \textit{one-stage approach} と、確立したMRI再構成手法を使用した \textit{two-stage approach} の比較に重点を置いている。
提案手法は,マルチコイルk空間データを含む2つのMRIデータセットと,人間による注釈付きセグメンテーショングラウンドトラスを用いて検証する。
データ一貫性を考慮に入れた単純な2段階の手法は、このタスクのために特別に開発された複雑な特殊な手法を超越して、最高のセグメンテーションスコアにつながる。
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