論文の概要: Fast reconstruction of degenerate populations of conductance-based neuron models from spike times
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2509.12783v1
- Date: Tue, 16 Sep 2025 08:02:00 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-09-17 17:50:52.955498
- Title: Fast reconstruction of degenerate populations of conductance-based neuron models from spike times
- Title(参考訳): スパイク時間から導電性ニューロンモデルの退化集団の高速再構築
- Authors: Julien Brandoit, Damien Ernst, Guillaume Drion, Arthur Fyon,
- Abstract要約: スパイク時間は細胞内と細胞外の両方で実験的に記録することができ、最先端の神経プローブの主要な出力である。
スパイクタイミングをイオンチャネル組成に接続することは、これまでも困難な作業である。
深層学習と動的入力コンダクタンス(DIC)という理論ツールを組み合わせた手法を開発した。
我々のアプローチでは、深層学習を用いて、スパイク時間から直接DICを推定し、観察された活動を再現する「双子」ニューロンモデルの集団を生成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.226598527858578
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
- Abstract: Neurons communicate through spikes, and spike timing is a crucial part of neuronal processing. Spike times can be recorded experimentally both intracellularly and extracellularly, and are the main output of state-of-the-art neural probes. On the other hand, neuronal activity is controlled at the molecular level by the currents generated by many different transmembrane proteins called ion channels. Connecting spike timing to ion channel composition remains an arduous task to date. To address this challenge, we developed a method that combines deep learning with a theoretical tool called Dynamic Input Conductances (DICs), which reduce the complexity of ion channel interactions into three interpretable components describing how neurons spike. Our approach uses deep learning to infer DICs directly from spike times and then generates populations of "twin" neuron models that replicate the observed activity while capturing natural variability in membrane channel composition. The method is fast, accurate, and works using only spike recordings. We also provide open-source software with a graphical interface, making it accessible to researchers without programming expertise.
- Abstract(参考訳): ニューロンはスパイクを介して通信し、スパイクタイミングは神経処理の重要な部分である。
スパイク時間は細胞内と細胞外の両方で実験的に記録することができ、最先端の神経プローブの主要な出力である。
一方、神経活動は、イオンチャネルと呼ばれる多くの異なる膜貫通タンパク質が生成する電流によって分子レベルで制御される。
スパイクタイミングをイオンチャネル組成に接続することは、これまでも困難な作業である。
この課題に対処するため,我々は,深層学習と動的入力コンダクタンス(DIC)という理論ツールを組み合わせる手法を開発した。
我々のアプローチでは、深層学習を用いて、スパイク時間から直接DICを推定し、観察された活動を再現し、膜チャネル組成の自然変動を捉えながら「ツイン」ニューロンモデルの集団を生成する。
この方法は高速で正確で、スパイク記録のみを使用して動作する。
グラフィカルなインターフェースを備えたオープンソースソフトウェアも提供しています。
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