論文の概要: Explicit Path CGR: Maintaining Sequence Fidelity in Geometric Representations
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2509.18408v1
- Date: Mon, 22 Sep 2025 20:46:51 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-09-24 20:41:27.580142
- Title: Explicit Path CGR: Maintaining Sequence Fidelity in Geometric Representations
- Title(参考訳): 明示的経路CGR:幾何表現におけるシーケンス忠実性を維持する
- Authors: Sarwan Ali,
- Abstract要約: 本稿では,Reverse-CGR(R-CGR)とも呼ばれる新しい情報保存型カオスゲーム表現法を提案する。
本手法は,論理的算術精度制御を併用した明示的経路符号化による完全系列復元を実現する。
本稿では,生物配列分類におけるR-CGRの有効性を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.237172334460829
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: We present a novel information-preserving Chaos Game Representation (CGR) method, also called Reverse-CGR (R-CGR), for biological sequence analysis that addresses the fundamental limitation of traditional CGR approaches - the loss of sequence information during geometric mapping. Our method introduces complete sequence recovery through explicit path encoding combined with rational arithmetic precision control, enabling perfect sequence reconstruction from stored geometric traces. Unlike purely geometric approaches, our reversibility is achieved through comprehensive path storage that maintains both positional and character information at each step. We demonstrate the effectiveness of R-CGR on biological sequence classification tasks, achieving competitive performance compared to traditional sequence-based methods while providing interpretable geometric visualizations. The approach generates feature-rich images suitable for deep learning while maintaining complete sequence information through explicit encoding, opening new avenues for interpretable bioinformatics analysis where both accuracy and sequence recovery are essential.
- Abstract(参考訳): 本稿では,従来のCGR手法の基本的限界(幾何学的マッピングにおけるシーケンス情報の喪失)に対処する生物学的シーケンス解析のために,Reverse-CGR(R-CGR)と呼ばれる新しい情報保存型カオスゲーム表現法を提案する。
本手法は,論理的算術精度制御を併用した明示的経路符号化による完全シーケンス復元を導入し,保存された幾何トレースから完全シーケンス復元を可能にする。
純粋に幾何学的なアプローチとは異なり、我々の可逆性は各ステップにおける位置情報と文字情報の両方を保持する包括的経路記憶によって達成される。
本稿では,生物配列分類におけるR-CGRの有効性を実証し,解釈可能な幾何学的可視化を提供しながら,従来のシーケンスベース手法と比較して競合性能を実現する。
本手法は,完全シーケンス情報を明示的エンコーディングを通じて保持しつつ,精度とシーケンス回復が不可欠である解釈可能なバイオインフォマティクス解析のための新たな経路を開きながら,ディープラーニングに適した特徴豊富な画像を生成する。
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