論文の概要: Neu-RadBERT for Enhanced Diagnosis of Brain Injuries and Conditions
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2510.06232v1
- Date: Wed, 01 Oct 2025 11:54:33 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-10-09 16:41:20.038325
- Title: Neu-RadBERT for Enhanced Diagnosis of Brain Injuries and Conditions
- Title(参考訳): Neu-RadBERTによる脳損傷・病態の診断
- Authors: Manpreet Singh, Sean Macrae, Pierre-Marc Williams, Nicole Hung, Sabrina Araujo de Franca, Laurent Letourneau-Guillon, François-Martin Carrier, Bang Liu, Yiorgos Alexandros Cavayas,
- Abstract要約: BERTをベースとしたモデルであるNeu-RadBERTを開発した。
Neu-RadBERTは急性脳損傷に対して98.0%の精度を達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 18.847689562649453
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Objective: We sought to develop a classification algorithm to extract diagnoses from free-text radiology reports of brain imaging performed in patients with acute respiratory failure (ARF) undergoing invasive mechanical ventilation. Methods: We developed and fine-tuned Neu-RadBERT, a BERT-based model, to classify unstructured radiology reports. We extracted all the brain imaging reports (computed tomography and magnetic resonance imaging) from MIMIC-IV database, performed in patients with ARF. Initial manual labelling was performed on a subset of reports for various brain abnormalities, followed by fine-tuning Neu-RadBERT using three strategies: 1) baseline RadBERT, 2) Neu-RadBERT with Masked Language Modeling (MLM) pretraining, and 3) Neu-RadBERT with MLM pretraining and oversampling to address data skewness. We compared the performance of this model to Llama-2-13B, an autoregressive LLM. Results: The Neu-RadBERT model, particularly with oversampling, demonstrated significant improvements in diagnostic accuracy compared to baseline RadBERT for brain abnormalities, achieving up to 98.0% accuracy for acute brain injuries. Llama-2-13B exhibited relatively lower performance, peaking at 67.5% binary classification accuracy. This result highlights potential limitations of current autoregressive LLMs for this specific classification task, though it remains possible that larger models or further fine-tuning could improve performance. Conclusion: Neu-RadBERT, enhanced through target domain pretraining and oversampling techniques, offered a robust tool for accurate and reliable diagnosis of neurological conditions from radiology reports. This study underscores the potential of transformer-based NLP models in automatically extracting diagnoses from free text reports with potential applications to both research and patient care.
- Abstract(参考訳): 目的: 急性呼吸不全(ARF)患者の脳画像の自由テキスト画像から, 侵襲的機械的換気を施行した症例の診断を抽出する分類アルゴリズムの開発を試みた。
方法: BERTモデルであるNeu-RadBERTを開発した。
ARF患者を対象にMIMIC-IVデータベースから全脳画像(CTおよびMRI)を抽出した。
各種脳異常の報告のサブセットに初期手動ラベリングを行い,3つの方法を用いた微調整したNeu-RadBERTを施行した。
1)RadBERT,
2)masked Language Modeling (MLM)によるNeu-RadBERTの事前学習
3)Nu-RadBERTとMLMの事前学習とオーバーサンプリングにより,データの歪みに対処する。
このモデルの性能を自己回帰型LLMであるLlama-2-13Bと比較した。
結果:Neu-RadBERTモデル,特にオーバーサンプリングでは,脳障害に対するベースラインRadBERTと比較して診断精度が有意に向上し,急性脳損傷に対する98.0%の精度が達成された。
Llama-2-13Bは比較的低い性能を示し、67.5%のバイナリ分類精度でピークに達した。
この結果は、この特定の分類タスクに対する現在の自己回帰LDMの潜在的な制限を強調するが、より大きなモデルやさらなる微調整によって性能が向上する可能性がある。
結論:Neu-RadBERTは、標的領域の事前訓練およびオーバーサンプリング技術を通じて強化され、放射線学報告から神経疾患の正確かつ確実な診断のための堅牢なツールを提供する。
本研究は、フリーテキストレポートから自動的に診断を抽出するトランスフォーマーベースのNLPモデルの可能性と、研究と患者ケアの両方への応用の可能性を明らかにする。
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