論文の概要: MODE: Learning compositional representations of complex systems with Mixtures Of Dynamical Experts
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2510.09594v1
- Date: Fri, 10 Oct 2025 17:52:31 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-10-14 00:38:49.508971
- Title: MODE: Learning compositional representations of complex systems with Mixtures Of Dynamical Experts
- Title(参考訳): MODE:動的エキスパートの混合による複雑なシステムの構成表現の学習
- Authors: Nathan Quiblier, Roy Friedman, Matthew Ricci,
- Abstract要約: MODEはグラフィカルなモデリングフレームワークで、ニューラルネットワークのゲーティング機構は複雑なダイナミクスをスパースで解釈可能なコンポーネントに分解する。
我々は,MODEが細胞生物学における重要なサイクリングおよび分岐過程をシミュレートする,挑戦的な予測タスクにどのように成功したかを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.250743580183822
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Dynamical systems in the life sciences are often composed of complex mixtures of overlapping behavioral regimes. Cellular subpopulations may shift from cycling to equilibrium dynamics or branch towards different developmental fates. The transitions between these regimes can appear noisy and irregular, posing a serious challenge to traditional, flow-based modeling techniques which assume locally smooth dynamics. To address this challenge, we propose MODE (Mixture Of Dynamical Experts), a graphical modeling framework whose neural gating mechanism decomposes complex dynamics into sparse, interpretable components, enabling both the unsupervised discovery of behavioral regimes and accurate long-term forecasting across regime transitions. Crucially, because agents in our framework can jump to different governing laws, MODE is especially tailored to the aforementioned noisy transitions. We evaluate our method on a battery of synthetic and real datasets from computational biology. First, we systematically benchmark MODE on an unsupervised classification task using synthetic dynamical snapshot data, including in noisy, few-sample settings. Next, we show how MODE succeeds on challenging forecasting tasks which simulate key cycling and branching processes in cell biology. Finally, we deploy our method on human, single-cell RNA sequencing data and show that it can not only distinguish proliferation from differentiation dynamics but also predict when cells will commit to their ultimate fate, a key outstanding challenge in computational biology.
- Abstract(参考訳): 生命科学における力学系は、しばしば重なり合う行動状態の複雑な混合から成る。
細胞サブポピュレーションはサイクリングから平衡力学へ、あるいは分岐によって異なる発達の運命へと移行する。
これらのレジーム間の遷移は騒々しく不規則に見え、局所的な滑らかな力学を仮定する伝統的なフローベースモデリング技術に深刻な挑戦を巻き起こす。
この課題に対処するために、我々は、複雑なダイナミクスをスパースで解釈可能なコンポーネントに分解するグラフィカル・モデリング・フレームワークであるMODE(Mixture of Dynamical Experts)を提案する。
重要なことは、我々のフレームワークのエージェントは異なる統治法に飛び乗ることができるため、MODEは上記のノイズ遷移に特に適している。
計算生物学から合成データセットと実データセットのバッテリを用いて,本手法の評価を行った。
まず、雑音や少数サンプルの設定を含む合成動的スナップショットデータを用いて、教師なし分類タスクでMODEを体系的にベンチマークする。
次に,MODEが細胞生物学における重要なサイクリングおよび分岐過程をシミュレートする予測タスクにどのように成功したかを示す。
最後に,本手法をヒト単細胞RNAシークエンシングデータに展開し,分化動態と分化動態を区別するだけでなく,細胞が究極的な運命にいつコミットするかを予測する。
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