論文の概要: Spatiotemporal Transformers for Predicting Avian Disease Risk from Migration Trajectories
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2510.15254v1
- Date: Fri, 17 Oct 2025 02:33:33 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-10-20 20:17:34.443027
- Title: Spatiotemporal Transformers for Predicting Avian Disease Risk from Migration Trajectories
- Title(参考訳): 移動軌道からの鳥病リスク予測のための時空間変換器
- Authors: Dingya Feng, Dingyuan Xue,
- Abstract要約: 本研究は,渡り鳥軌道の終点における感染リスクを予測するためのトランスフォーマーベースのフレームワークを提案する。
我々は、Movebankのデータ、World for Animal Healthのアウトブレイク記録など、マルチソースの地理空間データセットを統合する。
このモデルは、鳥の動きシーケンスから依存を学習し、病気のリスクを見積もる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Accurate forecasting of avian disease outbreaks is critical for wildlife conservation and public health. This study presents a Transformer-based framework for predicting the disease risk at the terminal locations of migratory bird trajectories. We integrate multi-source datasets, including GPS tracking data from Movebank, outbreak records from the World Organisation for Animal Health (WOAH), and geospatial context from GADM and Natural Earth. The raw coordinates are processed using H3 hierarchical geospatial encoding to capture spatial patterns. The model learns spatiotemporal dependencies from bird movement sequences to estimate endpoint disease risk. Evaluation on a held-out test set demonstrates strong predictive performance, achieving an accuracy of 0.9821, area under the ROC curve (AUC) of 0.9803, average precision (AP) of 0.9299, and an F1-score of 0.8836 at the optimal threshold. These results highlight the potential of Transformer architectures to support early-warning systems for avian disease surveillance, enabling timely intervention and prevention strategies.
- Abstract(参考訳): 鳥の病気の発生の正確な予測は、野生生物の保護と公衆衛生にとって重要である。
本研究は,渡り鳥軌道の終点における感染リスクを予測するためのトランスフォーマーベースのフレームワークを提案する。
我々は、MovebankのGPS追跡データ、WOAH(World Organisation for Animal Health)のアウトブレイク記録、GADMとNatural Earthの地理空間コンテキストを含むマルチソースデータセットを統合する。
原座標は、H3階層地理空間符号化を用いて処理され、空間パターンをキャプチャする。
このモデルは、鳥の動きシーケンスから時空間的依存関係を学習し、エンドポイントの病気リスクを推定する。
ホールドアウトテストセットの評価は強い予測性能を示し、精度0.9821、精度0.9803、平均精度0.9299、F1スコア0.8836である。
これらの結果は、トランスフォーマーアーキテクチャーが早期警戒システムをサポートし、鳥の病気の監視を支援し、タイムリーな介入と予防戦略を可能にする可能性を浮き彫りにしている。
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