論文の概要: Automatic Classification of Circulating Blood Cell Clusters based on Multi-channel Flow Cytometry Imaging
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2510.17716v1
- Date: Mon, 20 Oct 2025 16:32:23 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-10-25 00:56:39.527905
- Title: Automatic Classification of Circulating Blood Cell Clusters based on Multi-channel Flow Cytometry Imaging
- Title(参考訳): 多チャンネルフローサイトメトリーイメージングによる循環血球クラスターの自動分類
- Authors: Suqiang Ma, Subhadeep Sengupta, Yao Lee, Beikang Gu, Xianyan Chen, Xianqiao Wang, Yang Liu, Mengjia Xu, Galit H. Frydman, He Li,
- Abstract要約: 赤血球(RBCs)、白血球(WBCs)、血小板を含む循環血液細胞クラスター(CCCs)は、血栓症、感染、炎症などの病態に関連する重要なバイオマーカーである。
蛍光染色と組み合わせたフローは、これらの細胞クラスターを解析するために一般的に使われ、細胞の形態やタンパク質のプロファイルを明らかにする。
本研究では,CCC画像の解析とクラスタ内のセルタイプ同定のための新しい計算フレームワークを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.696386233227689
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Circulating blood cell clusters (CCCs) containing red blood cells (RBCs), white blood cells(WBCs), and platelets are significant biomarkers linked to conditions like thrombosis, infection, and inflammation. Flow cytometry, paired with fluorescence staining, is commonly used to analyze these cell clusters, revealing cell morphology and protein profiles. While computational approaches based on machine learning have advanced the automatic analysis of single-cell flow cytometry images, there is a lack of effort to build tools to automatically analyze images containing CCCs. Unlike single cells, cell clusters often exhibit irregular shapes and sizes. In addition, these cell clusters often consist of heterogeneous cell types, which require multi-channel staining to identify the specific cell types within the clusters. This study introduces a new computational framework for analyzing CCC images and identifying cell types within clusters. Our framework uses a two-step analysis strategy. First, it categorizes images into cell cluster and non-cluster groups by fine-tuning the You Only Look Once(YOLOv11) model, which outperforms traditional convolutional neural networks (CNNs), Vision Transformers (ViT). Then, it identifies cell types by overlaying cluster contours with regions from multi-channel fluorescence stains, enhancing accuracy despite cell debris and staining artifacts. This approach achieved over 95% accuracy in both cluster classification and phenotype identification. In summary, our automated framework effectively analyzes CCC images from flow cytometry, leveraging both bright-field and fluorescence data. Initially tested on blood cells, it holds potential for broader applications, such as analyzing immune and tumor cell clusters, supporting cellular research across various diseases.
- Abstract(参考訳): 赤血球(RBCs)、白血球(WBCs)、血小板を含む循環血液細胞クラスター(CCCs)は、血栓症、感染、炎症などの病態に関連する重要なバイオマーカーである。
フローサイトメトリーは、蛍光染色と組み合わせて、これらの細胞クラスターを分析し、細胞の形態やタンパク質のプロファイルを明らかにするために一般的に用いられる。
機械学習に基づく計算手法は単細胞フローサイトメトリー画像の自動解析を進歩させてきたが、CCCを含む画像を自動的に解析するツールを構築するための努力が不足している。
単細胞とは異なり、細胞クラスターはしばしば不規則な形や大きさを示す。
さらに、これらの細胞クラスターは、しばしば異種細胞型からなり、クラスタ内の特定の細胞タイプを特定するために、マルチチャネル染色を必要とする。
本研究では,CCC画像を解析し,クラスタ内のセルタイプを特定するための新しい計算フレームワークを提案する。
私たちのフレームワークは2段階の分析戦略を使用します。
まず、従来の畳み込みニューラルネットワーク(CNN)、ビジョントランスフォーマー(ViT)よりも優れたYou Only Look Once(YOLOv11)モデルを微調整することで、イメージをセルクラスタと非クラスタグループに分類する。
そして、多チャンネル蛍光染色の領域とクラスター輪郭をオーバーレイすることで細胞タイプを特定し、細胞の破片や染色物に拘わらず精度を向上する。
このアプローチは、クラスタ分類と表現型識別の両方において95%以上の精度を達成した。
まとめると、我々の自動フレームワークはフローサイトメトリーからCCC画像を効果的に分析し、明るさ場と蛍光データの両方を活用する。
当初は血液細胞で試験されたが、免疫や腫瘍細胞クラスターの分析、様々な疾患における細胞研究の支援など、幅広い応用の可能性を秘めている。
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