論文の概要: Causal Structure and Representation Learning with Biomedical Applications
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2511.04790v1
- Date: Thu, 06 Nov 2025 20:17:58 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-11-10 21:00:44.578896
- Title: Causal Structure and Representation Learning with Biomedical Applications
- Title(参考訳): バイオメディカル応用による因果構造と表現学習
- Authors: Caroline Uhler, Jiaqi Zhang,
- Abstract要約: 基礎的なバイオメディカルな質問に動機づけられた因果構造と表現学習のための統計的・計算的な枠組みを概説する。
本研究では、観測データと摂動データを効果的に利用して、観測された因果変数の因果探索を行う方法について述べる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 23.11061319442
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Massive data collection holds the promise of a better understanding of complex phenomena and, ultimately, better decisions. Representation learning has become a key driver of deep learning applications, as it allows learning latent spaces that capture important properties of the data without requiring any supervised annotations. Although representation learning has been hugely successful in predictive tasks, it can fail miserably in causal tasks including predicting the effect of a perturbation/intervention. This calls for a marriage between representation learning and causal inference. An exciting opportunity in this regard stems from the growing availability of multi-modal data (observational and perturbational, imaging-based and sequencing-based, at the single-cell level, tissue-level, and organism-level). We outline a statistical and computational framework for causal structure and representation learning motivated by fundamental biomedical questions: how to effectively use observational and perturbational data to perform causal discovery on observed causal variables; how to use multi-modal views of the system to learn causal variables; and how to design optimal perturbations.
- Abstract(参考訳): 膨大なデータ収集は、複雑な現象をよりよく理解し、究極的にはより良い決定を約束する。
表現学習は、教師付きアノテーションを必要とせず、データの重要な特性をキャプチャする潜在空間の学習を可能にするため、ディープラーニングアプリケーションの重要な原動力となっている。
表現学習は予測的タスクで非常に成功したが、摂動・介入の効果を予測することを含む因果的タスクで失敗する可能性がある。
これは表現学習と因果推論の結婚を要求する。
この点におけるエキサイティングな機会は、マルチモーダルデータ(観察的、摂動的、画像ベース、シークエンシングに基づく、単一細胞レベル、組織レベル、生物レベル)の可用性の増加にある。
基礎的な生物医学的疑問によって動機付けられた因果構造と表現学習の統計的・計算的枠組みを概説する。観察された因果変数の因果発見に効果的に観察的・摂動的データを利用する方法,因果変数の学習にシステムのマルチモーダルビューを使用する方法,最適な摂動を設計する方法である。
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