論文の概要: Glioma C6: A Novel Dataset for Training and Benchmarking Cell Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2511.07286v1
- Date: Mon, 10 Nov 2025 16:33:34 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-11-11 21:18:45.370524
- Title: Glioma C6: A Novel Dataset for Training and Benchmarking Cell Segmentation
- Title(参考訳): Glioma C6: 細胞セグメンテーションのトレーニングとベンチマークのための新しいデータセット
- Authors: Roman Malashin, Svetlana Pashkevich, Daniil Ilyukhin, Arseniy Volkov, Valeria Yachnaya, Andrey Denisov, Maria Mikhalkova,
- Abstract要約: Glioma C6は、グリオーマC6細胞のサンプルセグメンテーションのための新しいオープンデータセットである。
データセットは75個の高分解能位相コントラスト顕微鏡画像と12,000以上の注釈付き細胞からなる。
ソマアノテーションや、生物学者が提供した形態学的細胞分類が含まれる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: We present Glioma C6, a new open dataset for instance segmentation of glioma C6 cells, designed as both a benchmark and a training resource for deep learning models. The dataset comprises 75 high-resolution phase-contrast microscopy images with over 12,000 annotated cells, providing a realistic testbed for biomedical image analysis. It includes soma annotations and morphological cell categorization provided by biologists. Additional categorization of cells, based on morphology, aims to enhance the utilization of image data for cancer cell research. Glioma C6 consists of two parts: the first is curated with controlled parameters for benchmarking, while the second supports generalization testing under varying conditions. We evaluate the performance of several generalist segmentation models, highlighting their limitations on our dataset. Our experiments demonstrate that training on Glioma C6 significantly enhances segmentation performance, reinforcing its value for developing robust and generalizable models. The dataset is publicly available for researchers.
- Abstract(参考訳): 我々は、グリオーマC6細胞の例分割のための新しいオープンデータセットであるGlioma C6を、ディープラーニングモデルのためのベンチマークとトレーニングリソースとして設計した。
このデータセットは、75個の高分解能位相コントラスト顕微鏡画像と12,000以上のアノテート細胞から構成され、バイオメディカル画像解析のための現実的なテストベッドを提供する。
ソマアノテーションや、生物学者が提供した形態学的細胞分類が含まれる。
形態学に基づく細胞の追加分類は、がん細胞研究における画像データの利用を高めることを目的としている。
Glioma C6は2つの部分から構成される: 1つはベンチマークのための制御されたパラメータでキュレーションされ、もう1つは様々な条件下での一般化テストをサポートする。
我々は,いくつかの一般化セグメンテーションモデルの性能を評価し,その限界をデータセット上で強調する。
実験により,Glioma C6のトレーニングはセグメンテーション性能を大幅に向上させ,ロバストで一般化可能なモデルを開発する上での価値を高めた。
データセットは研究者向けに公開されている。
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