論文の概要: Rank-Aware Agglomeration of Foundation Models for Immunohistochemistry Image Cell Counting
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2511.12588v1
- Date: Sun, 16 Nov 2025 13:18:06 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-11-18 14:36:24.392474
- Title: Rank-Aware Agglomeration of Foundation Models for Immunohistochemistry Image Cell Counting
- Title(参考訳): 免疫組織化学画像カウントのための基礎モデルのランクアウェアアグリゲーション
- Authors: Zuqi Huang, Mengxin Tian, Huan Liu, Wentao Li, Baobao Liang, Jie Wu, Fang Yan, Zhaoqing Tang, Zhongyu Li,
- Abstract要約: 複数の強力な基礎モデルから知識を抽出するランクアウェア・アグロメレーション・フレームワークを提案する。
その結果,CountIHCは12種類のIHCバイオマーカーと5種類の組織にまたがって最先端の手法を超越していることがわかった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.781544447677007
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Accurate cell counting in immunohistochemistry (IHC) images is critical for quantifying protein expression and aiding cancer diagnosis. However, the task remains challenging due to the chromogen overlap, variable biomarker staining, and diverse cellular morphologies. Regression-based counting methods offer advantages over detection-based ones in handling overlapped cells, yet rarely support end-to-end multi-class counting. Moreover, the potential of foundation models remains largely underexplored in this paradigm. To address these limitations, we propose a rank-aware agglomeration framework that selectively distills knowledge from multiple strong foundation models, leveraging their complementary representations to handle IHC heterogeneity and obtain a compact yet effective student model, CountIHC. Unlike prior task-agnostic agglomeration strategies that either treat all teachers equally or rely on feature similarity, we design a Rank-Aware Teacher Selecting (RATS) strategy that models global-to-local patch rankings to assess each teacher's inherent counting capacity and enable sample-wise teacher selection. For multi-class cell counting, we introduce a fine-tuning stage that reformulates the task as vision-language alignment. Discrete semantic anchors derived from structured text prompts encode both category and quantity information, guiding the regression of class-specific density maps and improving counting for overlapping cells. Extensive experiments demonstrate that CountIHC surpasses state-of-the-art methods across 12 IHC biomarkers and 5 tissue types, while exhibiting high agreement with pathologists' assessments. Its effectiveness on H&E-stained data further confirms the scalability of the proposed method.
- Abstract(参考訳): 免疫組織化学(IHC)画像における正確な細胞カウントは、タンパク質の発現を定量化し、がんの診断を支援するために重要である。
しかし、染色体重複、可変バイオマーカー染色、および多様な細胞形態が原因で、この課題は依然として困難なままである。
回帰ベースのカウント手法は、重複したセルを扱う場合に検出ベースのカウントよりも利点があるが、エンドツーエンドのマルチクラスカウントをサポートすることは滅多にない。
さらに、基礎モデルのポテンシャルは、このパラダイムにおいてほとんど過小評価されていない。
これらの制約に対処するため、我々は、複数の強力な基礎モデルから知識を選択的に抽出し、その相補表現を利用してIHCの不均一性に対処し、コンパクトで効果的な学生モデルであるCountIHCを得るランクアウェア・アグロメレーションフレームワークを提案する。
全ての教師を平等に扱うか、特徴的類似性に頼っている従来のタスク非依存のアグロメレーション戦略とは異なり、我々は、各教師固有の数え上げ能力を評価し、サンプルワイズな教師選択を可能にする、グローバル・ローカル・パッチランキングをモデル化するランク・アウェア・教師選択(RATS)戦略を設計する。
マルチクラスセルカウントでは,タスクを視覚言語アライメントとして再構成する微調整ステージを導入する。
構造化されたテキストから導かれる離散意味アンカーは、カテゴリ情報と量情報の両方をエンコードし、クラス固有の密度マップの回帰を導き、重複するセルのカウントを改善する。
広範囲にわたる実験により、CountIHCは12のIHCバイオマーカーと5種類の組織にまたがる最先端の手法を超越し、病理学者の評価と高い一致を示した。
H&Eデータに対するその有効性は,提案手法のスケーラビリティをさらに確認する。
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