論文の概要: A New Family of Poisson Non-negative Matrix Factorization Methods Using the Shifted Log Link
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2601.05845v1
- Date: Fri, 09 Jan 2026 15:16:54 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-01-12 17:41:49.999467
- Title: A New Family of Poisson Non-negative Matrix Factorization Methods Using the Shifted Log Link
- Title(参考訳): シフトログリンクを用いたポアソン非負行列分解法
- Authors: Eric Weine, Peter Carbonetto, Rafael A. Irizarry, Matthew Stephens,
- Abstract要約: シフトログリンク機能を備えたPoisson NMFを提案する。
ポアソンNMFにおけるリンク関数の選択が、どのようにして結果に瞬時に影響を及ぼすかを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.368245632896611
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Poisson non-negative matrix factorization (NMF) is a widely used method to find interpretable "parts-based" decompositions of count data. While many variants of Poisson NMF exist, existing methods assume that the "parts" in the decomposition combine additively. This assumption may be natural in some settings, but not in others. Here we introduce Poisson NMF with the shifted-log link function to relax this assumption. The shifted-log link function has a single tuning parameter, and as this parameter varies the model changes from assuming that parts combine additively (i.e., standard Poisson NMF) to assuming that parts combine more multiplicatively. We provide an algorithm to fit this model by maximum likelihood, and also an approximation that substantially reduces computation time for large, sparse datasets (computations scale with the number of non-zero entries in the data matrix). We illustrate these new methods on a variety of real datasets. Our examples show how the choice of link function in Poisson NMF can substantively impact the results, and how in some settings the use of a shifted-log link function may improve interpretability compared with the standard, additive link.
- Abstract(参考訳): ポアソン非負行列分解(ポアソン非負行列分解、英: Poisson non- negative matrix factorization、NMF)は、カウントデータの解釈可能な「部分」分解を見つけるために広く用いられる方法である。
ポアソン NMF の多くの変種が存在するが、既存の方法は分解の「部分」が加法的に結合すると仮定している。
この仮定は、ある設定では自然かもしれませんが、他の設定ではそうではありません。
ここでは、この仮定を緩和するために、シフトログリンク関数を持つPoisson NMFを紹介する。
シフトログリンク関数は、単一のチューニングパラメータを持ち、このパラメータが変化するにつれて、部品が加法的に(つまり標準ポアソンNMF)結合することを仮定するから、部品がより乗法的に結合することを仮定するまでの間、モデルの変化が変化する。
我々は,このモデルを最大限の確率で適合させるアルゴリズムと,大小のデータセットの計算時間を著しく短縮する近似(計算量とデータマトリックス内のゼロでないエントリ数)を提供する。
我々は,これらの新しい手法を,様々な実際のデータセットで説明する。
我々の例は、Poisson NMFにおけるリンク関数の選択が結果に瞬時に影響を及ぼすかを示し、いくつかの設定ではシフトログリンク関数を用いることで、標準の付加的リンクよりも解釈性が向上することを示した。
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