論文の概要: FlowMorph: Physics-Consistent Self-Supervision for Label-Free Single-Cell Mechanics in Microfluidic Videos
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2601.17947v1
- Date: Sun, 25 Jan 2026 18:57:36 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-01-27 15:23:08.555118
- Title: FlowMorph: Physics-Consistent Self-Supervision for Label-Free Single-Cell Mechanics in Microfluidic Videos
- Title(参考訳): FlowMorph: マイクロ流体ビデオにおけるラベルフリー単セルメカニクスのための物理抵抗型セルフスーパービジョン
- Authors: Bora Yimenicioglu, Vishal Manikanden,
- Abstract要約: 赤血球の力学的性質は、血液疾患や全身疾患に対して有望なバイオマーカーである。
本稿では,ラベルフリーなスカラー・メカニクス・プロキシであるFlowMorphについて,短時間の光場マイクロ流体ビデオからRBC毎に$k$で学習する自己教師型フレームワークを紹介した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Mechanical properties of red blood cells (RBCs) are promising biomarkers for hematologic and systemic disease, motivating microfluidic assays that probe deformability at throughputs of $10^3$--$10^6$ cells per experiment. However, existing pipelines rely on supervised segmentation or hand-crafted kymographs and rarely encode the laminar Stokes-flow physics that governs RBC shape evolution. We introduce FlowMorph, a physics-consistent self-supervised framework that learns a label-free scalar mechanics proxy $k$ for each tracked RBC from short brightfield microfluidic videos. FlowMorph models each cell by a low-dimensional parametric contour, advances boundary points through a differentiable ''capsule-in-flow'' combining laminar advection and curvature-regularized elastic relaxation, and optimizes a loss coupling silhouette overlap, intra-cellular flow agreement, area conservation, wall constraints, and temporal smoothness, using only automatically derived silhouettes and optical flow. Across four public RBC microfluidic datasets, FlowMorph achieves a mean silhouette IoU of $0.905$ on physics-rich videos with provided velocity fields and markedly improves area conservation and wall violations over purely data-driven baselines. On $\sim 1.5\times 10^5$ centered sequences, the scalar $k$ alone separates tank-treading from flipping dynamics with an AUC of $0.863$. Using only $200$ real-time deformability cytometry (RT-DC) events for calibration, a monotone map $E=g(k)$ predicts apparent Young's modulus with a mean absolute error of $0.118$\,MPa on $600$ held-out cells and degrades gracefully under shifts in channel geometry, optics, and frame rate.
- Abstract(参考訳): 赤血球(RBC)の力学的性質は、血液学的および全身疾患のバイオマーカーとして有望であり、実験1回につき10^3$-10^6$のスループットで変形性を調査する微小流体測定を動機付けている。
しかし、既存のパイプラインは、教師付きセグメンテーションや手作りキモグラフに依存しており、RBC形状の進化を管理するラミナーストクスフロー物理学を符号化することは稀である。
本稿では,短時間の光場マイクロ流体ビデオから記録されたRBC毎に,ラベルのないスカラー力学プロキシ$k$を学習する物理一貫性の自己教師型フレームワークであるFlowMorphを紹介する。
FlowMorphは、低次元のパラメトリックな輪郭によって各セルをモデル化し、ラミナの対流と曲率規則化された弾性緩和を組み合わせた「カプセル・イン・フロー」を通じて境界点を前進させ、自動的に導出されたシルエットと光流のみを用いて、損失結合シルエットの重なり合い、細胞内の流れの一致、面積保存、壁の制約、時間的滑らかさを最適化する。
4つの公開RBCマイクロ流体データセット全体で、FlowMorphは物理リッチなビデオの平均シルエットIoUを0.905ドルで達成し、提供された速度場により、純粋にデータ駆動ベースラインよりも領域の保存と壁の侵害を著しく改善する。
$\sim 1.5\times 10^5$ Centered sequencesでは、スカラー$k$だけで、AUCが0.863$の反転力学からタンクトレッドを分離する。
キャリブレーションのためのRT-DC (Real-time deformability cytometry) イベントのみを用いて、モノトーンマップ$E=g(k)$は600ドルのホールトアウトセル上の平均絶対誤差が0.118$\,MPaであり、チャネル幾何学、光学、フレームレートのシフトの下で優雅に劣化する。
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