論文の概要: Automated HER2 scoring with uncertainty quantification using lensfree holography and deep learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2601.18219v1
- Date: Mon, 26 Jan 2026 07:09:08 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-01-27 15:23:08.715067
- Title: Automated HER2 scoring with uncertainty quantification using lensfree holography and deep learning
- Title(参考訳): レンズレスホログラフィーとディープラーニングを用いた不確実性定量化によるHER2自動スコアリング
- Authors: Che-Yung Shen, Xilin Yang, Yuzhu Li, Leon Lenk, Aydogan Ozcan,
- Abstract要約: 本稿では,HER2自動スコアリングにディープラーニングを統合した,コンパクトで費用対効果の高いホログラフィプラットフォームを提案する。
このシステムは、RGBレーザー照射下で染色されたHER2組織の無レンズ回折パターンをキャプチャする。
サンプル面積1,250 mm2の複雑なフィールド情報を有効スループット84 mm2/分で取得する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.815557531820863
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Accurate assessment of human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) expression is critical for breast cancer diagnosis, prognosis, and therapy selection; yet, most existing digital HER2 scoring methods rely on bulky and expensive optical systems. Here, we present a compact and cost-effective lensfree holography platform integrated with deep learning for automated HER2 scoring of immunohistochemically stained breast tissue sections. The system captures lensfree diffraction patterns of stained HER2 tissue sections under RGB laser illumination and acquires complex field information over a sample area of ~1,250 mm^2 at an effective throughput of ~84 mm^2 per minute. To enhance diagnostic reliability, we incorporated an uncertainty quantification strategy based on Bayesian Monte Carlo dropout, which provides autonomous uncertainty estimates for each prediction and supports reliable, robust HER2 scoring, with an overall correction rate of 30.4%. Using a blinded test set of 412 unique tissue samples, our approach achieved a testing accuracy of 84.9% for 4-class (0, 1+, 2+, 3+) HER2 classification and 94.8% for binary (0/1+ vs. 2+/3+) HER2 scoring with uncertainty quantification. Overall, this lensfree holography approach provides a practical pathway toward portable, high-throughput, and cost-effective HER2 scoring, particularly suited for resource-limited settings, where traditional digital pathology infrastructure is unavailable.
- Abstract(参考訳): ヒト上皮成長因子受容体2(HER2)の発現の正確な評価は、乳癌の診断、予後、治療選択に重要である。
本稿では,免疫組織化学的に染色された乳房組織断面のHER2自動スコアリングに,ディープラーニングと統合されたコンパクトで費用対効果の高いレンズレスホログラフィープラットフォームを提案する。
このシステムは、RGBレーザー照射下での染色HER2組織断面の無レンズ回折パターンを捕捉し、有効スループットが約84mm^2の試料領域の複素場情報を取得する。
診断信頼性を高めるため,ベイジアンモンテカルロのドロップアウトに基づく不確実性定量化戦略を導入し,予測毎に自律的不確実性推定を行い,信頼性の高いHER2スコアをサポートし,全体の補正率は30.4%となった。
412種類の組織試料を盲検で測定した結果, 4-class (0, 1+, 2+, 3+) HER2 分類では84.9%, バイナリ (0/1+ vs. 2+/3+) HER2 評価では94.8%, 不確実性定量化では84.9%であった。
全体として、このレンズフリーホログラフィーアプローチは、ポータブルで高スループットで費用対効果の高いHER2スコアへの実践的な経路を提供する。
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