論文の概要: Physiologically Informed Deep Learning: A Multi-Scale Framework for Next-Generation PBPK Modeling
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2602.18472v1
- Date: Mon, 09 Feb 2026 00:26:01 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-02 07:21:25.597648
- Title: Physiologically Informed Deep Learning: A Multi-Scale Framework for Next-Generation PBPK Modeling
- Title(参考訳): 生理学的インフォームドディープラーニング:次世代PBPKモデリングのためのマルチスケールフレームワーク
- Authors: Shunqi Liu, Han Qiu, Tong Wang,
- Abstract要約: メカニスティックリガーとデータ駆動の柔軟性を橋渡しするSciML(SciML)フレームワークを提案する。
1) 薬物動態予測をシーケンスモデリングタスクとして扱う基盤PBPK変換器,(2) 生理的制約付き拡散モデル(PCDM),(3) 生物学的に適合した仮想患者集団を合成するための物理インフォームドロスを用いた生成アプローチ,(3) ニューラルネットワークとニューラルネットワークを組み合わせたハイブリッドアーキテクチャであるニューラルアロメトリー,などを紹介する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.007023403094322
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Physiologically Based Pharmacokinetic (PBPK) modeling is a cornerstone of model-informed drug development (MIDD), providing a mechanistic framework to predict drug absorption, distribution, metabolism, and excretion (ADME). Despite its utility, adoption is hindered by high computational costs for large-scale simulations, difficulty in parameter identification for complex biological systems, and uncertainty in interspecies extrapolation. In this work, we propose a unified Scientific Machine Learning (SciML) framework that bridges mechanistic rigor and data-driven flexibility. We introduce three contributions: (1) Foundation PBPK Transformers, which treat pharmacokinetic forecasting as a sequence modeling task; (2) Physiologically Constrained Diffusion Models (PCDM), a generative approach that uses a physics-informed loss to synthesize biologically compliant virtual patient populations; and (3) Neural Allometry, a hybrid architecture combining Graph Neural Networks (GNNs) with Neural ODEs to learn continuous cross-species scaling laws. Experiments on synthetic datasets show that the framework reduces physiological violation rates from 2.00% to 0.50% under constraints while offering a path to faster simulation.
- Abstract(参考訳): PBPKモデリングは、薬物の吸収、分布、代謝、排他を予測するための機械的枠組みを提供する、モデルインフォームド・ドラッグ開発(MIDD)の基盤となる。
その実用性にもかかわらず、大規模シミュレーションにおける高い計算コスト、複雑な生物学的システムのパラメータ同定の難しさ、および種間外挿の不確実性によって、採用が妨げられている。
本研究では,機械的厳密さとデータ駆動の柔軟性を橋渡しする統一科学機械学習(SciML)フレームワークを提案する。
本稿では,(1)薬物動態予測をシーケンスモデリングタスクとして扱う基盤PBPK変換器,(2)生理的制約付き拡散モデル(PCDM),(3)生物学的に適合した仮想患者集団を合成するための物理情報損失を用いた生成手法,(3)ニューラルネットワークとニューラルネットワークを組み合わせたハイブリッドアーキテクチャ,の3つを紹介する。
合成データセットの実験により、このフレームワークはより高速なシミュレーションへの経路を提供しながら、生理的違反率を2.00%から0.50%に下げることを示した。
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