論文の概要: PIS: A Physics-Informed System for Accurate State Partitioning of $Aβ_{42}$ Protein Trajectories
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2602.19444v1
- Date: Mon, 23 Feb 2026 02:27:18 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-02-24 17:42:02.649008
- Title: PIS: A Physics-Informed System for Accurate State Partitioning of $Aβ_{42}$ Protein Trajectories
- Title(参考訳): PIS:$Aβ_{42}$タンパク質軌道の正確な状態分割のための物理インフォームドシステム
- Authors: Qianfeng Yu, Ningkang Peng, Yanhui Gu,
- Abstract要約: 我々は、堅牢な準安定状態分割のために設計された物理インフォームドシステムであるPISを紹介する。
我々のモデルは、$A_42$データセット上で優れた性能を達成する。
PISは、物理特性の動的監視と多次元結果検証を特徴とするインタラクティブなプラットフォームを提供する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.7874902461360627
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Understanding the conformational evolution of $β$-amyloid ($Aβ$), particularly the $Aβ_{42}$ isoform, is fundamental to elucidating the pathogenic mechanisms underlying Alzheimer's disease. However, existing end-to-end deep learning models often struggle to capture subtle state transitions in protein trajectories due to a lack of explicit physical constraints. In this work, we introduce PIS, a Physics-Informed System designed for robust metastable state partitioning. By integrating pre-computed physical priors, such as the radius of gyration and solvent-accessible surface area, into the extraction of topological features, our model achieves superior performance on the $Aβ_{42}$ dataset. Furthermore, PIS provides an interactive platform that features dynamic monitoring of physical characteristics and multi-dimensional result validation. This system offers biological researchers a powerful set of analytical tools with physically grounded interpretability. A demonstration video of PIS is available on https://youtu.be/AJHGzUtRCg0.
- Abstract(参考訳): Aβ$-アミロイド(Aβ$)、特にAβ_{42}$アイソフォームのコンフォメーション進化を理解することは、アルツハイマー病の根底にある病原的なメカニズムを解明するための基礎となる。
しかし、既存のエンドツーエンドのディープラーニングモデルは、明示的な物理的制約が欠如しているため、タンパク質軌道の微妙な状態遷移を捉えるのに苦労することが多い。
本研究では,ロバストな準安定状態分割のための物理インフォームドシステムであるPISを紹介する。
ジャイレーション半径や溶媒可溶性表面積といった計算済みの物理前駆体をトポロジカルな特徴の抽出に組み込むことで,Aβ_{42}$データセット上で優れた性能が得られる。
さらに、PISは、物理特性の動的監視と多次元結果検証を特徴とするインタラクティブなプラットフォームを提供する。
このシステムは、生物学的研究者に、物理的に接地された解釈可能性を持つ強力な分析ツールセットを提供する。
PISのデモビデオはhttps://youtu.be/AJHGzUtRCg0.comで公開されている。
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