論文の概要: Partial Causal Structure Learning for Valid Selective Conformal Inference under Interventions
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.02204v1
- Date: Mon, 02 Mar 2026 18:58:22 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-03 19:50:57.048407
- Title: Partial Causal Structure Learning for Valid Selective Conformal Inference under Interventions
- Title(参考訳): 干渉による正定性選択等角推論のための部分因果構造学習
- Authors: Amir Asiaee, Kavey Aryan, James P. Long,
- Abstract要約: ゲノミクスの実験では、交換可能性はしばしば、対象変数を「影響を受けない」ままにしておく介入のサブセットにのみ保持される。
i)「影響のない」キャリブレーション例の誤分類が、明示的な関数$g(,n)$の汚染分数とキャリブレーションセットサイズを介してどのようにカバレッジを劣化させるか、および (ii) 2つの後続指標$Z_a,i=mathbf1iinmathrmdesc(a)$のみを推定するタスク駆動部分因果学習の定式化。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Selective conformal prediction can yield substantially tighter uncertainty sets when we can identify calibration examples that are exchangeable with the test example. In interventional settings, such as perturbation experiments in genomics, exchangeability often holds only within subsets of interventions that leave a target variable "unaffected" (e.g., non-descendants of an intervened node in a causal graph). We study the practical regime where this invariance structure is unknown and must be learned from data. Our contributions are: (i) a contamination-robust conformal coverage theorem that quantifies how misclassification of "unaffected" calibration examples degrades coverage via an explicit function $g(δ,n)$ of the contamination fraction and calibration set size, providing a finite-sample lower bound that holds for arbitrary contaminating distributions; (ii) a task-driven partial causal learning formulation that estimates only the binary descendant indicators $Z_{a,i}=\mathbf{1}\{i\in\mathrm{desc}(a)\}$ needed for selective calibration, rather than the full causal graph; and (iii) algorithms for descendant discovery via perturbation intersection patterns (differentially affected variable set intersections across interventions), and for approximate distance-to-intervention estimation via local invariant causal prediction. We provide recovery conditions under which contamination is controlled. Experiments on synthetic linear structural equation models (SEMs) validate the bound: under controlled contamination up to $δ=0.30$, the corrected procedure maintains $\ge 0.95$ coverage while uncorrected selective CP degrades to $0.867$. A proof-of-concept on Replogle K562 CRISPR interference (CRISPRi) perturbation data demonstrates applicability to real genomic screens.
- Abstract(参考訳): 選択的共形予測は、テスト例と交換可能な校正例を特定できる場合、より厳密な不確実性集合が得られる。
ゲノミクスにおける摂動実験のような介入的設定では、交換可能性はしばしば、対象変数を「影響を受けない」(例えば、因果グラフ内の介在ノードの非依存者)に残した介入のサブセット内でのみ保持される。
我々は、この不変構造が未知であり、データから学ばなければならない実践的状況について考察する。
私たちの貢献は次のとおりです。
一 汚染率及び校正セットの大きさの明示関数$g(δ,n)$を介して「影響のない」校正例の誤分類がカバー範囲を格下げし、任意の汚染分布を保持する有限サンプルの下限を与えること。
(ii) タスク駆動型部分因果学習の定式化であって、完全な因果グラフではなく、選択的校正に必要となる$Z_{a,i}=\mathbf{1}\{i\in\mathrm{desc}(a)\}$を推定するものである。
三 摂動交叉パターンによる子孫発見アルゴリズム(介入間の可変集合交叉)及び局所不変因果予測による近距離干渉推定のためのアルゴリズム。
汚染が抑制される回復条件を提供する。
合成線形構造方程式モデル(SEMs)の実験では、制御された汚染下では最大$δ=0.30$まで、補正された手続きは$\ge 0.95$の範囲を維持し、修正されていない選択CPは$0.867$まで低下する。
Replogle K562 CRISPR干渉(CRISPRi)摂動データに対する概念実証は、実際のゲノムスクリーンに適用可能であることを示す。
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