論文の概要: Longitudinal Lesion Inpainting in Brain MRI via 3D Region Aware Diffusion
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.05693v1
- Date: Thu, 05 Mar 2026 21:34:47 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-09 13:17:44.5766
- Title: Longitudinal Lesion Inpainting in Brain MRI via 3D Region Aware Diffusion
- Title(参考訳): 脳MRIにおける3次元領域拡散による経時的病変の描出
- Authors: Zahra Karimaghaloo, Dumitru Fetco, Haz-Edine Assemlal, Hassan Rivaz, Douglas L. Arnold,
- Abstract要約: Denoising Diffusion Probabilistic Models (DDPM) に基づく新しい3次元縦塗装フレームワークを提案する。
我々のモデルは、知覚的忠実度の観点から、主要なベースライン(FastSurfer-LIT)を著しく上回ります。
このフレームワークは,LITが要求する24.30分に対して,平均処理時間2.53分を実現し,約10倍の高速化を実現している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.7547060531652057
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Accurate longitudinal analysis of brain MRI is often hindered by evolving lesions, which bias automated neuroimaging pipelines. While deep generative models have shown promise in inpainting these lesions, most existing methods operate cross-sectionally or lack 3D anatomical continuity. We present a novel pseudo-3D longitudinal inpainting framework based on Denoising Diffusion Probabilistic Models (DDPM). Our approach utilizes multi-channel conditioning to incorporate longitudinal context from distinct visits (t_1, t_2) and extends Region-Aware Diffusion (RAD) to the medical domain, focusing the generative process on pathological regions without altering surrounding healthy tissue. We evaluated our model against state-of-the-art baselines on longitudinal brain MRI from 93 patients. Our model significantly outperforms the leading baseline (FastSurfer-LIT) in terms of perceptual fidelity, reducing the Learned Perceptual Image Patch Similarity (LPIPS) distance from 0.07 to 0.03 while effectively eliminating inter-slice discontinuities. Furthermore, our model demonstrates high longitudinal stability with a Temporal Fidelity Index of 1.024, closely approaching the ideal value of 1.0 and substantially narrowing the gap compared to LIT's TFI of 1.22. Notably, the RAD mechanism provides a substantial gain in efficiency; our framework achieves an average processing time of 2.53 min per volume, representing approximately 10x speedup over the 24.30 min required by LIT. By leveraging longitudinal priors and region-specific denoising, our framework provides a highly reliable and efficient preprocessing step for the study of progressive neurodegenerative diseases. A derivative dataset consisting of 93 pre-processed scans used for testing will be available upon request after acceptance. Code will be released upon acceptance.
- Abstract(参考訳): 脳MRIの正確な経時的解析は、しばしば進化する病変によって妨げられる。
深部再生モデルではこれらの病変の塗布が期待できるが、既存のほとんどの手法では断面的あるいは解剖学的連続性が欠如している。
DDPM(Denoising Diffusion Probabilistic Models)に基づく新しい3次元鉛直塗装フレームワークを提案する。
提案手法は多チャンネルコンディショニングを用いて、異なる訪問(t_1, t_2)からの経時的コンテキストを取り入れ、医療領域への領域認識拡散(RAD)を延長し、周囲の健康組織を変化させることなく、病的領域に生成過程を集中させる。
93例の経時的脳MRIにおける最先端のベースラインについて検討した。
提案モデルでは,知覚的忠実度の観点からは最上位のベースライン(FastSurfer-LIT)を著しく上回り,Learred Perceptual Image Patch similarity (LPIPS) 距離を 0.07 から 0.03 に削減し,スライス間不連続性を効果的に排除した。
さらに,LIT のTFI 1.22 と比較すると,時間的忠実度指数 1.024 で高長手安定性を示し,理想値 1.0 に近づき,ギャップを著しく狭めている。
我々のフレームワークは、LITが要求する24.30分間の約10倍のスピードアップで、1ボリュームあたり平均2.53分間の処理時間を達成する。
縦断的偏執と地域特異的偏執を生かして, 進行性神経変性疾患の研究において, 信頼性が高く, 効率のよい前処理ステップを提供する。
テストに使用される93の事前処理スキャンからなるデリバティブデータセットは、受け入れ後、要求に応じて提供される。
コードは受理時にリリースされる。
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