論文の概要: RexDrug: Reliable Multi-Drug Combination Extraction through Reasoning-Enhanced LLMs
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.08166v1
- Date: Mon, 09 Mar 2026 09:47:25 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-10 15:13:15.745624
- Title: RexDrug: Reliable Multi-Drug Combination Extraction through Reasoning-Enhanced LLMs
- Title(参考訳): RexDrug: RexDrug-Reasoning-Enhanced LLMによる信頼性多剤複合抽出
- Authors: Zhijun Wang, Ling Luo, Dinghao Pan, Huan Zhuang, Lejing Yu, Yuanyuan Sun, Hongfei Lin,
- Abstract要約: RexDrugは、n-ary薬物の組み合わせ抽出のためのエンドツーエンドの推論強化関係抽出フレームワークである。
DrugCombデータセットの実験によると、RexDrugはn-ary抽出の最先端ベースラインを一貫して上回っている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 18.980650525232843
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Automated Drug Combination Extraction (DCE) from large-scale biomedical literature is crucial for advancing precision medicine and pharmacological research. However, existing relation extraction methods primarily focus on binary interactions and struggle to model variable-length n-ary drug combinations, where complex compatibility logic and distributed evidence need to be considered. To address these limitations, we propose RexDrug, an end-to-end reasoning-enhanced relation extraction framework for n-ary drug combination extraction based on large language models. RexDrug adopts a two-stage training strategy. First, a multi-agent collaborative mechanism is utilized to automatically generate high-quality expert-like reasoning traces for supervised fine-tuning. Second, reinforcement learning with a multi-dimensional reward function specifically tailored for DCE is applied to further refine reasoning quality and extraction accuracy. Extensive experiments on the DrugComb dataset show that RexDrug consistently outperforms state-of-the-art baselines for n-ary extraction. Additional evaluation on the DDI13 corpus confirms its generalizability to binary drugdrug interaction tasks. Human expert assessment and automatic reasoning metrics further indicates that RexDrug produces coherent medical reasoning while accurately identifying complex therapeutic regimens. These results establish RexDrug as a scalable and reliable solution for complex biomedical relation extraction from unstructured text. The source code and data are available at https://github.com/DUTIR-BioNLP/RexDrug
- Abstract(参考訳): 大規模生物医学文献からのDCE(Automated Drug Combination extract)は、精密医療と薬理学研究の進歩に不可欠である。
しかし、既存の関係抽出法は主に二項相互作用に重点を置いており、複雑な互換性論理と分散エビデンスを考慮する必要がある変数長のn-ary薬物の組み合わせのモデル化に苦慮している。
これらの制約に対処するために、大規模言語モデルに基づくn-ary薬物の組み合わせ抽出のためのエンドツーエンドの推論強化関係抽出フレームワークであるRexDrugを提案する。
RexDrugは2段階のトレーニング戦略を採用している。
まず、マルチエージェント協調機構を用いて、教師付き微調整のための高品質なエキスパートライクな推論トレースを自動的に生成する。
次に、DCEに適した多次元報酬関数を用いた強化学習を適用し、推論品質と抽出精度をさらに高める。
DrugCombデータセットの大規模な実験は、RexDrugがn-ary抽出の最先端ベースラインを一貫して上回っていることを示している。
DDI13コーパスのさらなる評価により、バイナリドラッグ相互作用タスクへの一般化性が確認された。
人間の専門家による評価と自動推論は、RexDrugが複雑な治療体制を正確に識別しながら、一貫性のある医学的推論を生み出すことを示している。
これらの結果は、非構造化テキストから複雑な生医学関係を抽出するためのスケーラブルで信頼性の高いソリューションとしてRexDrugを確立する。
ソースコードとデータはhttps://github.com/DUTIR-BioNLP/RexDrugで公開されている。
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