論文の概要: Recovering Sparse Neural Connectivity from Partial Measurements: A Covariance-Based Approach with Granger-Causality Refinement
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.18497v1
- Date: Thu, 19 Mar 2026 05:09:51 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-20 17:19:05.965868
- Title: Recovering Sparse Neural Connectivity from Partial Measurements: A Covariance-Based Approach with Granger-Causality Refinement
- Title(参考訳): 部分的測定によるスパース神経結合性の回復:グラナ-カジュラルリファインメントを用いた共分散に基づくアプローチ
- Authors: Quilee Simeon,
- Abstract要約: 不完全な観察から神経回路の接続を推定することは神経科学の根本的な課題である。
本稿では,複数セッション間の疎部分的測定から,リカレントニューラルネットワークの重み行列を推定するための共分散に基づく手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Inferring the connectivity of neural circuits from incomplete observations is a fundamental challenge in neuroscience. We present a covariance-based method for estimating the weight matrix of a recurrent neural network from sparse, partial measurements across multiple recording sessions. By accumulating pairwise covariance estimates across sessions where different subsets of neurons are observed, we reconstruct the full connectivity matrix without requiring simultaneous recording of all neurons. A Granger-causality refinement step enforces biological constraints via projected gradient descent. Through systematic experiments on synthetic networks modeling small brain circuits, we characterize a fundamental control-estimation tradeoff: stimulation aids identifiability but disrupts intrinsic dynamics, with the optimal level depending on measurement density. We discover that the ``incorrect'' linear approximation acts as implicit regularization -- outperforming the oracle estimator with known nonlinearity at all operating regimes -- and provide an exact characterization via the Stein--Price identity.
- Abstract(参考訳): 不完全な観察から神経回路の接続を推定することは神経科学の根本的な課題である。
本稿では,複数セッション間の疎部分的測定から,リカレントニューラルネットワークの重み行列を推定するための共分散に基づく手法を提案する。
ニューロンの異なるサブセットが観測されるセッション間でのペアワイズ共分散推定を蓄積することにより、全ニューロンの同時記録を必要とせず、完全な接続行列を再構築する。
グランガー因果性改善ステップは、投影された勾配降下によって生物学的制約を強制する。
小脳回路をモデル化する合成ネットワークの体系的な実験を通じて、刺激は識別可能性を助けるが、測定密度に応じて最適なレベルで本質的なダイナミクスを阻害する、基本的な制御-推定トレードオフを特徴付ける。
我々は、'不正確な'線形近似が暗黙の正則化として作用し、全ての操作状態において既知の非線形性を持つオラクル推定器よりも優れており、スタイン・プライス恒等式を通して正確な特徴づけを与えることを発見した。
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