論文の概要: Good Rankings, Wrong Probabilities: A Calibration Audit of Multimodal Cancer Survival Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.04239v1
- Date: Sun, 05 Apr 2026 19:47:04 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-07 15:49:19.000398
- Title: Good Rankings, Wrong Probabilities: A Calibration Audit of Multimodal Cancer Survival Models
- Title(参考訳): 有病率, 誤診確率:多モーダル癌生存モデルの校正調査
- Authors: Sajad Ghawami,
- Abstract要約: マルチモーダルWSI-ゲノミクスサバイバルアーキテクチャの最初の系統的な折りたたみレベル1-キャリブレーション監査を行う。
ゲーティングベースの核融合はより良いキャリブレーションと結びついており、双線形核融合と連結核融合はそうではない。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Multimodal deep learning models that fuse whole-slide histopathology images with genomic data have achieved strong discriminative performance for cancer survival prediction, as measured by the concordance index. Yet whether the survival probabilities derived from these models - either directly from native outputs or via standard post-hoc reconstruction - are calibrated remains largely unexamined. We conduct, to our knowledge, the first systematic fold-level 1-calibration audit of multimodal WSI-genomics survival architectures, evaluating native discrete-time survival outputs (Experiment A: 3 models on TCGA-BRCA) and Breslow-reconstructed survival curves from scalar risk scores (Experiment B: 11 architectures across 5 TCGA cancer types). In Experiment A, all three models fail 1-calibration on a majority of folds (12 of 15 fold-level tests reject after Benjamini-Hochberg correction). Across the full 290 fold-level tests, 166 reject the null of correct calibration at the median event time after Benjamini-Hochberg correction (FDR = 0.05). MCAT achieves C-index 0.817 on GBMLGG yet fails 1-calibration on all five folds. Gating-based fusion is associated with better calibration; bilinear and concatenation fusion are not. Post-hoc Platt scaling reduces miscalibration at the evaluated horizon (e.g., MCAT: 5/5 folds failing to 2/5) without affecting discrimination. The concordance index alone is insufficient for evaluating survival models intended for clinical use.
- Abstract(参考訳): ゲノムデータと全スライディング組織像を融合したマルチモーダル深層学習モデルは,コンコーダンス指標によって測定された癌生存予測において,強い識別性能を達成している。
しかし、これらのモデルから派生した生存確率(ネイティブアウトプットから直接、あるいは標準的なポストホックの再構築によって)が校正されるかどうかについては、ほとんど検討されていない。
我々の知る限り、我々は、マルチモーダルなWSI-ゲノミクスサバイバルアーキテクチャの最初の体系的な折りたたみレベル1-キャリブレーション監査を行い、ネイティブな離散時間サバイバル出力(実験A: TCGA-BRCA上の3モデル)とスカラーリスクスコアからのブレスロー再構成サバイバル曲線(実験B: 5 TCGAがんタイプ11のアーキテクチャ)を評価した。
実験Aでは、3つのモデルが折りたたみ式の多数で1-校正に失敗する(ベンジャミン・ホックバーグの修正後に15の折りたたみレベルのテストのうち12が拒否される)。
完全な290回の折りたたみ試験で、166はベンジャミン=ホックベルク補正(FDR = 0.05)後の中央イベント時間における正しい校正の無効を拒絶した。
MCAT は GBMLGG 上で C-index 0.817 を達成するが、5つの折り目すべてで 1-校正に失敗する。
ゲーティングベースの核融合はより良いキャリブレーションと結びついており、双線形核融合と連結核融合はそうではない。
ポストホットプラットスケーリングは、評価された地平線(例えば、MCAT:5/5の折り目は2/5に失敗する)での誤校正を、差別に影響を与えることなく減少させる。
コンコータンス指数だけでは臨床目的の生存モデルを評価するには不十分である。
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