論文の概要: Loop-Extrusion Linkage: Spectral Ordering and Interval-Based Structure Discovery for Continuous Optimization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.04273v1
- Date: Sun, 05 Apr 2026 21:26:21 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-07 15:49:19.019142
- Title: Loop-Extrusion Linkage: Spectral Ordering and Interval-Based Structure Discovery for Continuous Optimization
- Title(参考訳): Loop-Extrusion Linkage:連続最適化のためのスペクトル順序付けと区間構造探索
- Authors: Eren Unlu,
- Abstract要約: 本稿では,適応変数インター推定,ファイドラーベクトルによるスペクトルセレーション,適応間隔に基づく部分空間探索を組み合わせた構造学習ラッパーであるLoop-Extrusion(LEL)演算子を紹介する。
特定の構造仮説を変調したd=96の6つの診断関数についてLELを評価した。
結果は、ホルム=ボンフェロニ補正とヴァルガ=デレーニーA12効果の大きさでウィルコクソンのサインランク試験によって評価される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The rapid growth of nature-inspired metaheuristics has exposed a persistent gap between metaphorical novelty and genuine algorithmic advancement. Motivated by the biophysics of chromatin loop extrusion -- a well-characterized genome-folding process driven by SMC motor complexes and conditional barriers -- we introduce the Loop-Extrusion Linkage (LEL) operator, a structure-learning wrapper that combines online variable-interaction estimation, spectral seriation via the Fiedler vector, and adaptive interval-based subspace search. LEL constructs a sparse interaction graph from successful optimization steps, derives a heuristic one-dimensional variable ordering, and generates overlapping evaluation subsets through stochastic interval growth modulated by learned boundary-crossing probabilities. We evaluate LEL on six synthetic diagnostic functions at d=96 designed to probe specific structural hypotheses -- contiguous blocks, permuted blocks, overlapping windows, banded chains, separable controls, and dense rotated couplings -- across 10^4 and 5 x 10^4 evaluation budgets with 15 independent seeds. Results are assessed via the Wilcoxon signed-rank test with Holm-Bonferroni correction and Vargha-Delaney A12 effect sizes. At 10^4 evaluations, Full LEL achieves the best median log-gap on 3 of 6 functions significantly outperforming all ablations and jSO on the structured tasks. At 5 x 10^4 evaluations, simpler ablations and baselines often surpass the full method, indicating that the adaptive barrier mechanism may over-constrain late-stage search on uniformly partitioned landscapes. The strongest supported finding is that learned spectral ordering consistently improves over graph-only grouping and random variable ordering, suggesting that interaction-graph seriation is the most valuable component of the proposed framework.
- Abstract(参考訳): 自然に触発されたメタヒューリスティックスの急速な成長は、比喩的新奇性と真のアルゴリズムの進歩の間に永続的なギャップを露呈している。
クロマチンループ押出法(SMCモーターコンプレックスと条件付きバリアによって駆動される、よくキャラクタライズされたゲノム折り畳み法)の生体物理学により、オンライン変数-相互作用推定、Fiedlerベクターによるスペクトルセレーション、適応間隔に基づく部分空間探索を組み合わせた構造学習ラッパーであるLoop-Extrusion Linkage (LEL)演算子を導入する。
LELは、最適化に成功したステップからスパース相互作用グラフを構築し、ヒューリスティックな1次元変数順序付けを導出し、学習された境界交差確率によって変調された確率的間隔成長を通じて重なり合う評価部分集合を生成する。
特定構造仮説 (連続ブロック, 置換ブロック, 重なり合う窓, 帯状鎖, 分離制御, 密な回転結合) を, 10^4 と 5 x 10^4 の評価予算に対して 15 個の独立種で探索するために設計した d=96 において, LEL を6つの合成診断関数で評価した。
結果は、ホルム=ボンフェロニ補正とヴァルガ=デレーニーA12効果の大きさでウィルコクソンのサインランク試験によって評価される。
10^4の評価では、フルLELは6つの関数のうち3つの関数で最高の中央値のログギャップを達成し、構造化されたタスクにおける全てのアブレーションとjSOを著しく上回っている。
5×10^4の評価では、より単純な短縮とベースラインが完全な手法を超越することが多く、適応障壁機構が一様に区切られた風景の後期探索を過剰に抑制する可能性があることを示している。
最も支持されている発見は、学習されたスペクトル順序付けがグラフのみのグルーピングとランダムな変数順序付けよりも一貫して改善されることであり、相互作用グラフセレーションが提案されたフレームワークの最も重要なコンポーネントであることを示している。
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