論文の概要: CMGL: Confidence-guided Multi-omics Graph Learning for Cancer Subtype Classification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.24201v1
- Date: Mon, 27 Apr 2026 09:02:50 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-28 17:12:07.871227
- Title: CMGL: Confidence-guided Multi-omics Graph Learning for Cancer Subtype Classification
- Title(参考訳): CMGL:癌サブタイプ分類のための信頼誘導マルチオミクスグラフ学習
- Authors: Boyang Fan, Hengchuang Yin, Siyu Yi, Yifan Wang, Zhicheng Li, Leijiyu Zhou, Jiancheng Lv, Wei Ju,
- Abstract要約: 本稿では,明らかな深層学習を通じて,サンプルごとのモダリティの信頼性を推定するフレームワークCMGLを提案する。
CMGLは最強のベースラインを継続的に上回り、4つのシングルカンサータスクの平均精度を4.03%上回っている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 23.394649656767257
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Motivation: Multi-omics integration can improve cancer subtyping, but modality informativeness and noise vary across cancer types and patients. Existing graph-based methods optimize modality weights jointly with the classification objective and therefore lack independent reliability estimates, so low-quality omics distort patient similarity graphs and amplify noise through message passing. Results: We propose CMGL, a two-stage framework that estimates per-sample modality reliability through evidential deep learning and uses the frozen confidence scores to guide cross-omics fusion and graph construction. On four MLOmics cancer-subtype tasks and the 32-class pan-cancer task, CMGL consistently improves over the strongest baseline, surpassing it by 4.03% in average accuracy on the four single-cancer tasks. Its representations recover the PAM50 intrinsic subtypes of breast invasive carcinoma (BRCA), and the BRCA-trained model transfers without fine-tuning to kidney renal clear cell carcinoma (KIRC), stratifying patients into prognostically distinct groups.
- Abstract(参考訳): モチベーション(Motivation):マルチオミクスの統合は、がんのサブタイピングを改善することができるが、モダリティ情報性とノイズは、がんの種類や患者によって異なる。
既存のグラフベースの手法は、分類目的と共同でモダリティ重みを最適化し、したがって独立した信頼性推定を欠いているため、低品質のオミクスは患者類似性グラフを歪め、メッセージパッシングを通じてノイズを増幅する。
結果: CMGLは,明快な深層学習を通じて,サンプルごとのモダリティの信頼性を推定する2段階のフレームワークであり,凍結した信頼度スコアを用いて,クロスオミクス融合とグラフ構築のガイドを行う。
4つのMLOmics癌サブタイプタスクと32クラスのパンがんタスクでは、CMGLは最強のベースラインよりも一貫して改善され、4つの単一がんタスクの平均精度は4.03%向上した。
その表現は、乳腺浸潤癌(BRCA)のPAM50内在性サブタイプを回復させ、BRCAにより訓練されたモデルが腎クリア細胞癌(KIRC)に微調整することなく移行し、患者を予後に異なるグループに分類する。
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