論文の概要: Aycromo: An Open-Source Platform for Automatic Chromosome Detection in Metaphase Images Based on Deep Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.24685v1
- Date: Mon, 27 Apr 2026 16:45:49 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-28 17:12:08.180481
- Title: Aycromo: An Open-Source Platform for Automatic Chromosome Detection in Metaphase Images Based on Deep Learning
- Title(参考訳): Aycromo: ディープラーニングに基づくメタフェーズ画像の自動染色体検出のためのオープンソースプラットフォーム
- Abstract要約: AIを用いた細胞遺伝解析のためのオープンソースのデスクトッププラットフォームであるAycromoを紹介する。
ElectronとONNXをベースとして開発されたこのツールは、細胞遺伝学者が事前訓練されたモデルを読み込んで、検出を比較し、手動で修正することを可能にする。
このプラットフォームはスライダー毎の分析を数秒に短縮する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.5647577824219207
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Chromosome analysis is a fundamental step in the diagnosis of genetic diseases, but the manual karyotyping workflow is time-consuming and heavily dependent on expert specialists, often requiring several days per patient. Although Deep Learning models have achieved high performance in chromosome detection, most proposed solutions remain restricted to research prototypes or lack graphical interfaces suitable for clinical use. In this work, we present Aycromo, an open-source desktop platform for AI-assisted cytogenetic analysis. Built on Electron and ONNX Runtime, the tool allows cytogeneticists to load pre-trained models, compare architectures through an integrated benchmarking module, and manually correct detections via an interactive annotation interface, all without command-line interaction. Preliminary experiments on metaphase images from the CRCN-NE dataset demonstrate that YOLOv11 achieves 99.40% mAP@50, while the platform reduces per-slide analysis to seconds
- Abstract(参考訳): 染色体解析は遺伝子疾患の診断の基本的なステップであるが、手動の核型決定のワークフローは時間がかかり、専門家に大きく依存している。
ディープラーニングモデルは染色体検出において高い性能を達成しているが、ほとんどの提案された解決策は研究のプロトタイプに限られるか、臨床用途に適したグラフィカルインタフェースが欠如している。
本稿では,AIを用いた細胞遺伝解析のためのオープンソースのデスクトッププラットフォームであるAycromoを紹介する。
ElectronとONNX Runtime上に構築されたこのツールは、細胞遺伝学者が事前訓練されたモデルをロードし、統合されたベンチマークモジュールを通してアーキテクチャを比較し、コマンドラインの操作なしにインタラクティブなアノテーションインターフェースを介して手動で検出することを可能にする。
CRCN-NEデータセットの相画像に関する予備実験では、YOLOv11が99.40% mAP@50を達成するのに対し、プラットフォームはスライダー毎の解析を秒に短縮する。
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