論文の概要: Disease Is a Spectral Perturbation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.02949v1
- Date: Fri, 01 May 2026 17:01:04 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-05-06 19:35:43.52967
- Title: Disease Is a Spectral Perturbation
- Title(参考訳): 病気はスペクトル摂動である
- Authors: John D. Mayfield, Matthew S. Rosen,
- Abstract要約: そこで本研究では,バイオマーカーレベルの説明可能性を持つ健康なベースラインから病原体への形質転換を理解する新しい方法を提案する。
我々はこの枠組みを定式化し、疾患の摂動によるスペクトル変化を導出し、新たに診断された患者の累積バイオマーカー共分散構造の病原性固有モデムへの投影が、疾患予後の精度を高めるための最適な予後統計であることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.6629765271909503
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: We propose a novel method of understanding disease transformation from a healthy baseline with biomarker-level explainability. By modeling the biomarker covariance matrices of healthy controls and disease states, the perturbation can be individually characterized to accomplish mechanistic explanations of disease trajectories, both at a molecular level and for individual patients. Given a cohort of n patients each measured on p biomarkers, we define the biomarker "Hamiltonian" H = X^T X / n \in R^{p \times p}, where X \in R^{n \times p} is the covariant biomarker matrix. The eigenvectors of H define a set of normal modes of biomarker coordination, and the eigenvalues quantify the energy carried by each mode. In the healthy state, the reference Hamiltonian H_0 governs this structure where disease perturbs H_0 by an additive operator ΔH, thus shifting eigenvalues and rotating eigenvectors in proportion to the severity of pathological disruption. We formalize this framework, derive the spectral change given a disease perturbation, and demonstrate that the projection of a newly diagnosed patient's cumulative biomarker covariance structure onto disease-discriminant eigenmodes constitutes an optimal prognostic statistic for greater precision in disease prognosis. This work serves as a veritable white paper with application across a panoply of disease frameworks from cancer to neurodegenerative disorders.
- Abstract(参考訳): そこで本研究では,バイオマーカーレベルの説明可能性を持つ健康なベースラインから病原体への形質転換を理解する新しい方法を提案する。
健康な制御状態と疾患状態のバイオマーカー共分散行列をモデル化することにより、摂動を個別に特徴付けることができ、分子レベルでも個々の患者に対しても、疾患の軌跡の機械的説明を行うことができる。
p 個のバイオマーカーで測定された n 個の患者からなるコホートが与えられると、生物マーカー H = X^T X / n \in R^{p \times p} が定義される。
H の固有ベクトルは、バイオマーカー座標の正規モードの集合を定義し、固有値は各モードが持つエネルギーを定量化する。
健康状態において、ハミルトンH_0は、病気の摂動が加法作用素 ΔH によって H_0 を摂動するこの構造を支配し、それによって固有値と回転固有ベクトルを、病理破壊の深刻度に比例してシフトさせる。
我々はこの枠組みを定式化し、疾患の摂動によるスペクトル変化を導出し、新たに診断された患者の累積バイオマーカー共分散構造の病原性固有モデムへの投影が、疾患予後の精度を高めるための最適な予後統計であることを示す。
この研究は、がんから神経変性疾患まで、さまざまな病気の枠組みに適用できる検証可能なホワイトペーパーとして機能する。
関連論文リスト
- Graph Transformer-Based Pathway Embedding for Cancer Prognosis [12.185038682072213]
本稿では,遺伝子組換え戦略であるPATHを紹介する。
PATHは、各遺伝子に対する共有塩基の埋め込みから始めることでパラダイムシフトを表す。
PATHのF1スコアは0.8766で、現在のSOTAマルチオミクスベンチマークよりも8.8%改善している。
論文 参考訳(メタデータ) (2026-04-17T20:41:58Z) - R-GenIMA: Integrating Neuroimaging and Genetics with Interpretable Multimodal AI for Alzheimer's Disease Progression [63.97617759805451]
アルツハイマー病の早期発見には、マクロスケールの神経解剖学的変化とマイクロスケールの遺伝的感受性を統合できるモデルが必要である。
本稿では,新しいROIワイド・ビジョン・トランスフォーマと遺伝的プロンプトを結合した多モード多言語モデルR-GenIMAを紹介する。
R-GenIMAは、通常の認知、主観記憶、軽度認知障害、ADの4方向分類において最先端のパフォーマンスを達成する。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-12-22T02:54:10Z) - An Interpretable Ensemble Framework for Multi-Omics Dementia Biomarker Discovery Under HDLSS Conditions [0.0]
本稿では、グラフ注意ネットワーク(GAT)、マルチOmics Variational AutoEncoder(MOVE)、Elastic-net sparse regression、Storey's False Discovery Rate(FDR)を組み合わせた新しいアンサンブル手法を提案する。
シミュレーションされたマルチオミクスデータとアルツハイマー病神経画像イニシアチブ(ADNI)データセットを用いて評価を行った。
本手法は, 優れた予測精度, 特徴選択精度, 生物学的妥当性を示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-09-04T15:20:13Z) - MS-ConTab: Multi-Scale Contrastive Learning of Mutation Signatures for Pan Cancer Representation and Stratification [0.0]
43種類のがんをクラスタリングするための非教師なしコントラスト学習フレームワークを新たに導入する。
がんの種類ごとに2つの相補的な突然変異の署名を構築した。
得られた潜在表現が生物学的に有意ながんの集団を生じることを示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-08-26T20:42:20Z) - Unlasting: Unpaired Single-Cell Multi-Perturbation Estimation by Dual Conditional Diffusion Implicit Bridges [68.98973318553983]
本稿では,Dual Diffusion Implicit Bridges (DDIB) に基づくフレームワークを提案する。
我々は、生物学的に意味のある方法で摂動シグナルを伝達するために遺伝子制御ネットワーク(GRN)情報を統合する。
また、サイレント遺伝子を予測し、生成したプロファイルの品質を向上させるためのマスキング機構も組み込んだ。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-06-26T09:05:38Z) - Predicting Genetic Mutation from Whole Slide Images via Biomedical-Linguistic Knowledge Enhanced Multi-label Classification [119.13058298388101]
遺伝子変異予測性能を向上させるため,生物知識を付加したPathGenomic Multi-label Transformerを開発した。
BPGTはまず、2つの慎重に設計されたモジュールによって遺伝子前駆体を構成する新しい遺伝子エンコーダを確立する。
BPGTはその後ラベルデコーダを設計し、最終的に2つの調整されたモジュールによる遺伝的突然変異予測を行う。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-06-05T06:42:27Z) - Deep Learning Predicts Biomarker Status and Discovers Related
Histomorphology Characteristics for Low-Grade Glioma [21.281553456323998]
低次グリオーマ(LGG)の診断と治療にはバイオマーカー検出が不可欠である
ヘマトキシリンとエオシンを含む全スライド画像とスライドレベルのバイオマーカーステータスラベルを用いて,LGGの5つのバイオマーカーの状態を予測するための解釈可能なディープラーニングパイプラインを提案する。
我々のパイプラインはバイオマーカー予測の新しいアプローチを提供するだけでなく、LGG患者に対する分子治療の適用性を高めるだけでなく、分子機能とLGGの進行の新たなメカニズムの発見を促進する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-10-11T13:05:33Z) - Individual health-disease phase diagrams for disease prevention based on
machine learning [1.0617212070722408]
複数のバイオマーカーの境界値を可視化することにより、個人の健康状態を表すHDPD(Health-disease phase diagram)を提示する。
以上の結果から,HDPDは発症過程における個々の生理的状態を表わし,疾患予防の介入目標として利用できることが示唆された。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-05-31T08:25:02Z) - Domain Invariant Model with Graph Convolutional Network for Mammogram
Classification [49.691629817104925]
グラフ畳み込みネットワークを用いたドメイン不変モデル(DIM-GCN)を提案する。
まず,潜伏変数を病原性その他の疾患関連部位に明示的に分解するベイズネットワークを提案する。
マクロな特徴をよりよく捉えるために、我々は、GCN(Graph Convolutional Network)を介して、観察された臨床特性を再構築の目的として活用する。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-04-21T08:23:44Z) - Cancer Gene Profiling through Unsupervised Discovery [49.28556294619424]
低次元遺伝子バイオマーカーを発見するための,新しい,自動かつ教師なしのフレームワークを提案する。
本手法は,高次元中心型非監視クラスタリングアルゴリズムLP-Stabilityアルゴリズムに基づく。
私達の署名は免疫炎症および免疫砂漠の腫瘍の区別の有望な結果報告します。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-02-11T09:04:45Z) - G-MIND: An End-to-End Multimodal Imaging-Genetics Framework for
Biomarker Identification and Disease Classification [49.53651166356737]
診断によって誘導される画像データと遺伝データを統合し、解釈可能なバイオマーカーを提供する新しいディープニューラルネットワークアーキテクチャを提案する。
2つの機能的MRI(fMRI)パラダイムとSingle Nucleotide Polymorphism (SNP)データを含む統合失調症の集団研究で本モデルを評価した。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-01-27T19:28:04Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。