論文の概要: Machine Learning-Based Pre-Test Risk Stratification for PCR-Confirmed Chlamydia Using Patient-Reported Data and Urine Biomarkers
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.16365v1
- Date: Sat, 09 May 2026 19:21:59 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-05-19 23:51:08.296438
- Title: Machine Learning-Based Pre-Test Risk Stratification for PCR-Confirmed Chlamydia Using Patient-Reported Data and Urine Biomarkers
- Title(参考訳): 患者報告データと尿生マーカーを用いたPCR確認クラミジアの機械学習によるプレテストリスク階層化
- Abstract要約: Chlamydia trachomatis感染のリスクが高い個体の早期同定は、資源認識スクリーニングにおける分子試験の最適利用を可能にする可能性がある。
本研究では,日常的に利用可能な非侵襲的臨床データに基づいてトレーニングされた機械学習モデルを用いて,事前検査によるリスク階層化の可能性を評価する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Early identification of individuals at elevated risk of Chlamydia trachomatis infection may enable optimal use of molecular testing in resource-aware screening. We evaluate the feasibility of pre-test risk stratification (PTRS) using machine-learning models trained on routinely available, non-invasive clinical data. A curated dataset of 93 urine samples with PCR reference labels was analyzed using three feature groups: patient-reported history and symptoms, urine biomarkers from standard urinalysis, and their combination. Five supervised classifiers were evaluated using stratified 5-fold cross-validation with out-of-fold probability estimates. Performance was assessed using area under the receiver operating characteristic curve (AUC) and threshold-dependent metrics, with uncertainty quantified via bootstrap confidence intervals. Models using only patient-reported data showed moderate discrimination (AUC up to 0.72). Urine biomarker-based models demonstrated slightly lower peak discrimination but more consistent performance, with ensemble methods yielding the strongest results. Combining feature groups marginally increased the peak AUC and reduced performance variability across models, indicating improved robustness. Findings indicate that urine biomarkers provide a reliable predictive signal for PTRS that is complementary to patient-reported information, while feature integration enhances robustness. This work supports the integration of non-invasive, routinely available information for PTRS into screening workflows, including decentralized or home-based PCR contexts, to optimize testing prioritization.
- Abstract(参考訳): Chlamydia trachomatis感染のリスクが高い個体の早期同定は、資源認識スクリーニングにおける分子試験の最適利用を可能にする可能性がある。
日常的に利用可能な非侵襲的臨床データに基づいてトレーニングされた機械学習モデルを用いて、PTRS(pre-test risk stratification)の有効性を評価する。
PCRレファレンスラベルを用いた93個の尿サンプルのキュレートデータセットを, 患者報告歴と症状, 尿中バイオマーカー, およびそれらの組み合わせの3つの特徴群を用いて分析した。
5つの教師付き分類器を5倍のクロスバリデーションとアウト・オブ・フォールドの確率推定を用いて評価した。
受信機動作特性曲線(AUC)としきい値依存測定値(しきい値依存測定値)に基づいて,ブートストラップ信頼区間を介して不確かさを定量化した。
患者報告データのみを用いたモデルでは、中等度差別(AUC: 0.72 まで)が認められた。
尿中バイオマーカーを用いたモデルでは、ピークの識別はわずかに低いが、より一貫した性能を示し、アンサンブル法が最も高い結果を得た。
機能グループを組み合わせることで、AUCのピークがわずかに増加し、モデル間でのパフォーマンスが変動し、堅牢性が向上した。
尿のバイオマーカーは、患者が報告した情報と相補的なPTRSの信頼性の高い予測信号を提供するが、機能統合は堅牢性を高める。
この研究は、PTRSの非侵襲的で日常的に利用可能な情報を、分散化や家庭ベースのPCRコンテキストを含むスクリーニングワークフローに統合し、テストの優先順位付けを最適化するのをサポートする。
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