論文の概要: OpenHealth Lake: Designing and testing a data lakehouse platform for health applications
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.19922v1
- Date: Tue, 19 May 2026 14:45:59 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-05-20 15:03:09.407197
- Title: OpenHealth Lake: Designing and testing a data lakehouse platform for health applications
- Title（参考訳）: OpenHealth Lake: 医療アプリケーションのためのデータレイクハウスプラットフォームの設計とテスト
- Authors: Danilo Silva, Monika Moir, Cheryl Baxter, Tulio de Oliveira, Joicymara Xavier, Marcel Dunaiski,
- Abstract要約: OpenHealth Lakeは、データレイクハウスアーキテクチャ、データフェデレーション、FAIR原則に基づく、データ管理のプロトタイププラットフォームである。
現在のプロトタイププラットフォームは、ユーザフレンドリなWebサイト、オープンAPI、PythonとRパッケージで構成されており、ユーザは複数の方法でプラットフォームと対話できる。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 0.2539920413471809
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Data management can be a complex challenge in fields such as bioinformatics and health sciences, which continuously generate extensive heterogeneous datasets. In the context of collaborative global health initiatives, secure storage and sharing of data are crucial to support impactful research. However, the absence of a unified data management platform complicates efficient data exchange and governance within these initiatives. In this paper, we introduce the design process of OpenHealth Lake, a data management prototype platform based on a data lakehouse architecture, data federation, and the FAIR principles. The platform is designed using open-source tools, guided by system requirements identified in previously published studies and complemented by insights from the existing literature. The current prototype platform comprises a user-friendly website, an open API, Python and R packages, allowing users to interact with the platform in multiple ways. Through a user study that included participants with varying technical backgrounds, we showed that our proposed data management prototype is both usable and useful. Our prototype design showcases the adaptability, scalability, and reproducibility of a lakehouse system that can be used by any organisation. It is designed as a flexible and complementary approach that allows organisations to customise data management systems to their specific requirements and resources, including cloud-based or self-hosted storage choices.
- Abstract（参考訳）: データ管理は、バイオインフォマティクスや健康科学といった分野において複雑な課題になり得る。
協力的なグローバルヘルスイニシアチブの文脈では、安全なストレージとデータの共有は、影響のある研究を支援するために不可欠である。
しかし、統一データ管理プラットフォームが存在しないことは、これらのイニシアチブ内での効率的なデータ交換とガバナンスを複雑にします。
本稿では,データレイクハウスアーキテクチャ,データフェデレーション,FAIR原則に基づくデータ管理プロトタイププラットフォームであるOpenHealth Lakeの設計プロセスを紹介する。
プラットフォームはオープンソースツールを使用して設計されており、以前に公開された研究で特定されたシステム要件によってガイドされ、既存の文献からの洞察によって補完される。
現在のプロトタイププラットフォームは、ユーザフレンドリなWebサイト、オープンAPI、PythonとRパッケージで構成されており、ユーザは複数の方法でプラットフォームと対話できる。
さまざまな技術的背景を持つ参加者を含むユーザスタディを通じて,提案したデータ管理プロトタイプが有用かつ有用であることを示す。
私たちのプロトタイプ設計では、あらゆる組織で使用可能なレイクハウスシステムの適応性、スケーラビリティ、再現性を示しています。
柔軟性のある補完的なアプローチとして設計されており、クラウドベースやセルフホスト型ストレージの選択など、データ管理システムを独自の要件とリソースにカスタマイズすることができる。
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