論文の概要: LegSegNet: A Public Deep Learning System for Lower Extremity CT Tissue Segmentation and Quantification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.30829v1
- Date: Fri, 29 May 2026 04:33:56 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-01 20:56:50.385749
- Title: LegSegNet: A Public Deep Learning System for Lower Extremity CT Tissue Segmentation and Quantification
- Title(参考訳): LegSegNet:下肢CT組織分画と定量化のための公開ディープラーニングシステム
- Abstract要約: LegSegNetは下肢CT組織分画と体組成定量化のためのディープラーニングシステムである。
入力CTスキャンにより、LegSegNetは骨、骨格筋、皮下脂肪組織、および筋内脂肪組織を分離する。
LegSegNetは、ホールドアウトテストセットの平均Diceスコア89.31で、全体的なセグメンテーションのパフォーマンスを最高のものにしている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 9.556625323268959
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Lower extremity computed tomography (CT) contains clinically relevant information for body composition analysis, sarcopenia assessment, and musculoskeletal disease monitoring, but extracting these measurements at scale requires accurate tissue segmentation and an automated quantification workflow. Existing public segmentation tools are not designed for comprehensive lower extremity CT analysis, particularly for clinically important inter/intramuscular adipose tissue, and most public methods only provide mask prediction rather than an end-to-end quantification system. To address this problem, we present LegSegNet, a deep learning system for lower extremity CT tissue segmentation and body composition quantification. Given an input CT scan, LegSegNet segments bone, skeletal muscle, subcutaneous adipose tissue, and inter/intramuscular adipose tissue. It then computes quantitative tissue measurements for downstream analysis. We developed the segmentation model using 1,302 manually annotated CT slices and evaluated it on 900 held-out test slices, with all annotations reviewed by radiologists. We benchmark LegSegNet against a broad set of 2D segmentation methods, including CNN-based models, transformer-based models, and finetuned foundation models, and further evaluate its generalization on an external public CT dataset. LegSegNet achieves the best overall segmentation performance, with an average Dice score of 89.31 on the held-out test set. To our knowledge, LegSegNet is the first publicly available end-to-end system for lower extremity CT tissue segmentation and quantification, providing a practical evaluation tool for future computer vision research in medical image analysis. The code and model weights are available at: https://github.com/mazurowski-lab/LegSegNet
- Abstract(参考訳): 下肢CT(lower extremity Computed tomography)は、身体組成分析、サルコニア評価、筋骨格疾患モニタリングのための臨床情報を含むが、これらの測定を大規模に抽出するには、正確な組織分画と自動定量化ワークフローが必要である。
既存の公共セグメンテーションツールは、特に臨床的に重要な細胞間/筋肉間脂肪組織のための包括的下肢CT解析のために設計されておらず、ほとんどの公開方法は、エンドツーエンドの定量化システムよりもマスク予測のみを提供する。
この問題に対処するために,下肢CT組織分割と体組成定量化のための深層学習システムLegSegNetを提案する。
入力CTスキャンにより、LegSegNetは骨、骨格筋、皮下脂肪組織、および筋内脂肪組織を分離する。
その後、下流分析のための定量的組織計測を計算する。
1,302個の手書きCTスライスを用いてセグメンテーションモデルを構築し,900個のホールドアウトテストスライスで評価した。
我々は、CNNベースモデル、トランスフォーマーベースモデル、微調整基礎モデルを含む幅広い2Dセグメンテーション手法に対してLegSegNetをベンチマークし、その一般化を外部の公開CTデータセット上でさらに評価する。
LegSegNetは、ホールドアウトテストセットにおける平均Diceスコア89.31で、全体的なセグメンテーションのパフォーマンスを最高のものにしている。
我々の知る限り、LegSegNetは、CT組織分画と定量化の低いエンド・ツー・エンドシステムとして初めて公開されており、将来の医用画像解析におけるコンピュータビジョン研究のための実用的な評価ツールを提供する。
コードとモデルの重み付けは、https://github.com/mazurowski-lab/LegSegNet.comで入手できる。
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