論文の概要: Seeing Below the Limit of Detection: A Censored-Poisson Bayesian Latent-Growth Change-Point Detector (the Span Detector) for Serial ctDNA in HR+/HER2- Metastatic Breast Cancer
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.11876v1
- Date: Wed, 10 Jun 2026 09:59:13 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-11 16:42:38.401943
- Title: Seeing Below the Limit of Detection: A Censored-Poisson Bayesian Latent-Growth Change-Point Detector (the Span Detector) for Serial ctDNA in HR+/HER2- Metastatic Breast Cancer
- Title(参考訳): HR+/HER2-転移性乳癌における経時的ctDNA検出装置(Span Detector)の検討
- Authors: Aarchi Singh Thakur, Abhijoy Sarkar,
- Abstract要約: 市販の液体生検では、それぞれが独立したスナップショットとして、非検出を無として扱う。
我々は、非検出は左チャージされた観察であり、非検出と偽検出のパターンは、時間とともに、実用的な成長の証拠となると主張している。
本稿では,2値検出過程をモデル化した,検閲されたPoisson Bayesian遅延成長点検出器であるSpanを紹介する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Circulating-tumour DNA (ctDNA) carries evidence of drug resistance months before imaging shows it, but the earliest evidence lives below the assay's limit of detection (LoD): a nascent subclone is detected only intermittently, producing a flickering sequence of faint detects and non-detects. Commercial liquid biopsies treat each draw as an independent snapshot and a non-detect as nothing. We argue a non-detect is a left-censored observation, and the pattern of non-detects and faint detects over time carries actionable evidence of growth before any single value is trustworthy. We introduce Span, a censored-Poisson Bayesian latent-growth change-point detector that models the binary detection process, accumulates a sequential generalised-likelihood-ratio statistic for an upward change-point in the per-variant detection rate, and raises a competing-risks alarm with calibrated false-alarm control. Span has no learned weights, so there is nothing to overfit. On a synthetic cohort of HR+/HER2- metastatic breast cancer on first-line CDK4/6-inhibitor plus endocrine therapy, at a matched 10% false-alarm rate, Span roughly doubles the fraction of impending progressions caught three months ahead (indolent regime: 25% vs 11% for the snapshot), with a falsifiable dose-response: large for indolent emergence, vanishing for fast emergence. A value-trajectory baseline performs identically to the snapshot, isolating the gain to the censored detection model. The survival backbone matches a Cox baseline on real breast-cancer data (GBSG-2, n=686; C-index 0.67 vs 0.68), and on a real longitudinal cohort with clean biomarkers (PBC2, n=312) the same pipeline correctly declines to win, a falsifiable boundary test confirming the mechanism is regime-specific. All ctDNA trajectories are synthetic.
- Abstract(参考訳): 循環型腫瘍DNA(ctDNA)は、画像化される数ヶ月前に薬剤耐性の証拠を示すが、最も初期の証拠はアッセイの検出限界(LoD)より下にある。
市販の液体生検では、それぞれが独立したスナップショットとして、非検出を無として扱う。
非検出は左チャージされた観察であり、非検出と偽検出のパターンは、単一の値が信頼に値する前に、実用的な成長の証拠となる。
本研究では,2値検出過程をモデル化し,各変量検出速度における上向き変化点に対する逐次一般化様比統計を蓄積する,検閲されたポアソン型潜伏成長点検出器であるSpanを導入し,キャリブレーションされた偽アラーム制御による競合リスクアラームを上昇させる。
Spanには学習したウェイトがないので、過度に適合するものは何もありません。
初回CDK4/6-インヒビターと内分泌療法を併用したHR+/HER2-転移性乳癌の合成コホートにおいて、Spanは3ヶ月前(思春期:25%対11%)に捕えられた差し迫った進行率の約2倍の差を示した。
値軌道ベースラインはスナップショットと同一に動作し、検閲された検出モデルに利得を分離する。
生存バックボーンは、実際の乳がんデータ(GBSG-2, n=686; C-index 0.67 vs 0.68)上のCoxベースラインと一致し、クリーンなバイオマーカー(PBC2, n=312)と実際の長手コホートでは、同じパイプラインが正しく低下して勝利し、そのメカニズムがシステマティクス固有のものであることを確認した。
全てのctDNAトラジェクトリは合成される。
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