論文の概要: Transformer-Guided Graph Attention for Direct Cardiac Mesh Reconstruction: A Structural Digital Twin Framework
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.13188v1
- Date: Thu, 11 Jun 2026 10:55:55 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-12 15:55:27.739269
- Title: Transformer-Guided Graph Attention for Direct Cardiac Mesh Reconstruction: A Structural Digital Twin Framework
- Title(参考訳): Transformer-Guided Graph Attention for Direct Cardiac Mesh Reconstruction: a Structure Digital Twin Framework
- Authors: Abhishek H S, Akash Ganamukhi, Abhimanyu Suresh, Aditya G Hiremath, Prasad B Honnavalli, Adithya Balasubramanyam,
- Abstract要約: 私たちは、生の3D医療画像からスムーズでシミュレーション可能な心臓表面メッシュまで、単一のエンドツーエンドネットワークをトレーニングします。
コアは3D Swin Transformer Encoder-decoderで、CTまたはMRIボリュームから体積的特徴を抽出し、グラフ注意ネットワークヘッドと組み合わせて、反復的にテンプレートメッシュを変形して患者の心臓境界に適合させる。
すべてのメッシュは単一のフォワードパスで生成されます -- マーチングキューブもスムーズなフィルタも手作業によるクリーンアップも不要です。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Building patient-specific cardiac models sits at the heart of precision cardiology, yet getting those models into clinical use keeps running into the same wall: mesh generation is slow, messy, and frustrating. The standard workflow -- segmenting the image, running Marching Cubes, and then manually cleaning up the result -- is time-consuming, inconsistent across operators, and demands specialist knowledge most clinical teams do not have. We take a fundamentally different approach. Instead of treating segmentation and mesh generation as two separate problems, we train a single end-to-end network that goes directly from a raw 3D medical image to a smooth, simulation-ready cardiac surface mesh. The core is a 3D Swin Transformer encoder-decoder that extracts volumetric features from CT or MRI volumes, paired with a Graph Attention Network (GAT) head that iteratively deforms a template mesh to fit the patient's cardiac boundary. We tested on the MM-WHS 2017 benchmark using both CT and MRI. Segmentation scores were competitive (Dice of 0.84 on CT, 0.83 on MRI), but the primary focus is mesh quality: mean Chamfer distance of 1.8 mm, with 95th-percentile surface distance below 5 mm. Every mesh is produced in a single forward pass -- no Marching Cubes, no smoothing filters, no manual cleanup. We argue that for cardiac digital twin pipelines, geometric fidelity and topological correctness matter more than pixel-level Dice scores. By removing the post-processing bottleneck, this approach makes patient-specific cardiac simulation substantially more accessible for clinical use.
- Abstract(参考訳): 患者固有の心臓モデルの構築は、精度の高い心臓医学の中心にあるが、それらのモデルを臨床利用するためには、メッシュの生成は遅く、混乱し、イライラする。
標準的なワークフロー -- イメージのセグメンテーション、マーチングキューブの実行、結果の手作業によるクリーニング -- は、演算子間で一貫性がなく、ほとんどの臨床チームが持っていない専門知識を要求する。
私たちは根本的に異なるアプローチを取っています。
セグメンテーションとメッシュ生成を2つの別の問題として扱う代わりに、生の3D医療画像からスムーズでシミュレーション可能な心臓表面メッシュまで、単一のエンドツーエンドネットワークをトレーニングします。
コアは3D Swin Transformer Encoder-decoderで、CTまたはMRIボリュームから体積的特徴を抽出し、患者の心臓境界に合うようにテンプレートメッシュを反復的に変形するグラフ注意ネットワーク(GAT)ヘッドと組み合わせる。
CTとMRIの両方を用いてMM-WHS 2017ベンチマークで検討した。
セグメンテーションスコアは競争力があった(CTでは0.84、MRIでは0.83)が、主な焦点はメッシュの品質である。
すべてのメッシュは単一のフォワードパスで生成されます -- マーチングキューブもスムーズなフィルタも手作業によるクリーンアップも不要です。
心臓のデジタルツインパイプラインでは、幾何学的忠実度と位相的正しさがピクセルレベルのDiceスコアよりも重要であると論じる。
術後のボトルネックを取り除くことで、患者固有の心臓シミュレーションを臨床的に利用しやすくする。
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