論文の概要: Explicit Differentiable Slicing and Global Deformation for Cardiac Mesh Reconstruction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2409.02070v2
- Date: Sun, 20 Oct 2024 10:43:30 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-11-07 23:56:04.311157
- Title: Explicit Differentiable Slicing and Global Deformation for Cardiac Mesh Reconstruction
- Title(参考訳): 心臓メッシュ再建のための明示的微分スライシングと大域的変形
- Authors: Yihao Luo, Dario Sesia, Fanwen Wang, Yinzhe Wu, Wenhao Ding, Jiahao Huang, Fadong Shi, Anoop Shah, Amit Kaural, Jamil Mayet, Guang Yang, ChoonHwai Yap,
- Abstract要約: 医用画像からの心臓解剖のメッシュ再構築は, 形状, 運動計測, 生体物理シミュレーションに有用である。
従来のボクセルベースのアプローチは、イメージの忠実さを損なう前処理と後処理に依存している。
そこで本稿では,メッシュのスライスからメッシュへの勾配バックプロパゲーションを可能にする,新しい識別可能なボキセル化とスライシング(DVS)アルゴリズムを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.730291904586656
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Mesh reconstruction of the cardiac anatomy from medical images is useful for shape and motion measurements and biophysics simulations to facilitate the assessment of cardiac function and health. However, 3D medical images are often acquired as 2D slices that are sparsely sampled and noisy, and mesh reconstruction on such data is a challenging task. Traditional voxel-based approaches rely on pre- and post-processing that compromises image fidelity, while mesh-level deep learning approaches require mesh annotations that are difficult to get. Therefore, direct cross-domain supervision from 2D images to meshes is a key technique for advancing 3D learning in medical imaging, but it has not been well-developed. While there have been attempts to approximate the optimized meshes' slicing, few existing methods directly use 2D slices to supervise mesh reconstruction in a differentiable manner. Here, we propose a novel explicit differentiable voxelization and slicing (DVS) algorithm that allows gradient backpropagation to a mesh from its slices, facilitating refined mesh optimization directly supervised by the losses defined on 2D images. Further, we propose an innovative framework for extracting patient-specific left ventricle (LV) meshes from medical images by coupling DVS with a graph harmonic deformation (GHD) mesh morphing descriptor of cardiac shape that naturally preserves mesh quality and smoothness during optimization. Experimental results demonstrate that our method achieves state-of-the-art performance in cardiac mesh reconstruction tasks from CT and MRI, with an overall Dice score of 90% on multi-datasets, outperforming existing approaches. The proposed method can further quantify clinically useful parameters such as ejection fraction and global myocardial strains, closely matching the ground truth and surpassing the traditional voxel-based approach in sparse images.
- Abstract(参考訳): 医用画像からの心臓解剖のメッシュ再構築は、心臓機能と健康の評価を容易にするための形状・運動計測および生体物理シミュレーションに有用である。
しかし、3Dの医用画像はしばしば、わずかにサンプリングされノイズの多い2Dスライスとして取得され、そのようなデータのメッシュ再構築は難しい作業である。
従来のボクセルベースのアプローチは、イメージの忠実性を損なう前処理と後処理に頼っているが、メッシュレベルのディープラーニングアプローチでは、取得が難しいメッシュアノテーションが必要になる。
そのため、2次元画像からメッシュへのドメイン間直接監視は、医用画像における3次元学習を前進させる重要な技術であるが、まだ十分に開発されていない。
最適化メッシュスライシングを近似する試みがあるが、メッシュ再構築を異なる方法で監視するために2Dスライスを直接使用する方法はほとんどない。
本稿では,2次元画像上に定義された損失によって直接監督される洗練されたメッシュ最適化を実現するために,メッシュのスライスから勾配のバックプロパゲーションを可能にする,新しい識別可能なボキセル化とスライシング(DVS)アルゴリズムを提案する。
さらに,DVSとグラフ調和変形(GHD)メッシュ形態記述子を結合することにより,医用画像から患者固有の左室メッシュ(LV)を抽出する革新的な枠組みを提案する。
実験の結果,CTおよびMRIによる心メッシュ再建作業において,Diceスコアの90%をマルチデータセット上で達成し,既存手法より優れていた。
提案手法は, 抽出率や大域心筋病変などの臨床的に有用なパラメータを定量化し, 基礎的真実と密に一致し, スパース画像における従来のボクセルベースアプローチを克服する。
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