論文の概要: Do ECG Foundation Models Transfer to Rare Cardiac Diseases? Evidence from Brugada Syndrome Detection
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2607.03009v1
- Date: Fri, 03 Jul 2026 06:43:53 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-07-07 22:26:29.494775
- Title: Do ECG Foundation Models Transfer to Rare Cardiac Diseases? Evidence from Brugada Syndrome Detection
- Title(参考訳): 心臓疾患への心電図モデル導入 : Brugada 症候群の検出から
- Abstract要約: 大規模未ラベルの生理データに基づいてトレーニングされたファンデーションモデル(FM)は、医療人工知能にとって有望なパラダイムとして現れている。
本研究は、FMプレトレーニングが、心電図(ECG)表現型の改善以上の真の臨床一般化の利点をもたらすかどうかを考察する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Background: Foundation models (FMs) trained on large-scale unlabeled physiological data have emerged as a promising paradigm for medical artificial intelligence. Their ability to capture clinically meaningful, transferable representations for rare diseases remains largely unproven. This study investigates whether FM pre-training provides genuine clinical generalization benefits beyond improved optimization for rare electrocardiographic (ECG) phenotypes. Methods: We systematically evaluated nine publicly available ECG FMs for Brugada syndrome detection on the BrSwiss cohort (294 patients, 87 cases) and the independent external HUCA cohort (363 patients, 76 cases), under three strategies (from-scratch training, linear probing, full fine-tuning) across several configurations, including a 3% data ablation and zero-shot cross-site transfers. Results: Pre-training was necessary for high-capacity architectures unable to converge from scratch (AUC gain up to 0.411, p < 0.05), but gave no significant gain for compact architectures already converged on labeled data alone. On full BrSwiss, the best fine-tuned FM (ECG-CPC, AUC = 0.962) only marginally exceeded the strongest supervised baseline (ECG-CPC from scratch, AUC = 0.932; p = 0.091). At matched training-set size, the data-efficiency advantage on BrSwiss-3% (AUC gain = 0.055, p < 0.01) did not replicate on HUCA. Under zero-shot cross-site transfer, FM-based pipelines did not generalize better than supervised baselines, all approaching chance-level performance. Conclusion: For Brugada syndrome detection, FM pre-training is mechanical rather than semantic, providing optimization stability rather than transferable clinical knowledge. These findings challenge the assumption that large-scale pre-training inherently encodes clinically meaningful representations, highlighting the central role of model architecture and data-domain alignment.
- Abstract(参考訳): 背景: 大規模未ラベルの生理データに基づいて訓練されたファンデーションモデル(FM)は、医療人工知能にとって有望なパラダイムとして現れている。
稀な疾患に対する臨床的に有意義で伝達可能な表現を捉える能力はほとんど証明されていない。
本研究は、FMプレトレーニングが、心電図(ECG)表現型の改善以上の真の臨床一般化の利点をもたらすかどうかを考察する。
方法: BrSwiss cohort (294例, 87例) および独立したHUCA cohort (363例, 76例) におけるブルガダ症候群検出のための9つの公開ECG FMを, 3%データアブレーション, ゼロショットクロスサイト転送を含む3つの構成で, 系統的に評価した。
結果:スクラッチから収束できない高容量アーキテクチャ(AUCは0.411, p < 0.05まで上昇する)には事前トレーニングが必要であったが、ラベル付きデータのみに収束したコンパクトアーキテクチャには大きな利益が得られなかった。
完全なBrSwissでは、最高の微調整FM(ECG-CPC, AUC = 0.962)が最強の監督ベースライン(ECG-CPC, AUC = 0.932; p = 0.091)をわずかに上回った。
一致したトレーニングセットサイズでは、BrSwiss-3%(AUC gain = 0.055, p < 0.01)のデータ効率優位性はHUCAでは再現されなかった。
ゼロショットのクロスサイト転送では、FMベースのパイプラインは教師付きベースラインよりも一般化されず、いずれもチャンスレベルのパフォーマンスに近づいた。
結論: Brugada 症候群の検出においては,FM プレトレーニングは意味よりも機械的であり,伝達可能な臨床知識よりも最適化の安定性を提供する。
これらの知見は、大規模事前学習が本質的に臨床的に意味のある表現をコード化し、モデルアーキテクチャとデータドメインアライメントの中心的な役割を強調しているという仮定に挑戦する。
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