論文の概要: NEEDL-Bench: Dataset for Swiss Needle Cast and Stomata Detection in Microscopy Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2607.12076v1
- Date: Mon, 13 Jul 2026 18:54:19 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-07-15 17:08:29.936305
- Title: NEEDL-Bench: Dataset for Swiss Needle Cast and Stomata Detection in Microscopy Images
- Title(参考訳): NEEDL-Bench: 顕微鏡画像におけるスイス針鋳造と胃検出のためのデータセット
- Abstract要約: NEEDL-BenchはSwiss Needle Cast(SNC)の顕微鏡検出ベンチマークである。
Needl-Benchは、1082のダグラス・ファー・ニードルからの3250枚の注釈付き画像のデータセットであり、キーポイントとバウンディングボックス検出器の両方に注釈付きである。
我々は,このデータセットをベースラインとして検出するための複数の一般的なキーポイントとバウンディングボックス法を評価し,最大F1スコア0.8479を観測した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 39.66563302789307
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We present NEEDL-Bench, a microscopy detection benchmark for Swiss Needle Cast (SNC), a fungal disease of Douglas-fir trees. Douglas-fir is a keystone species of major ecological and economic importance as a softwood timber resource, and SNC affects productivity by forming sexual reproductive structures (pseudothecia) that emerge through the gas exchange pores (stomata) of the needles, thereby blocking gas exchange and compromising needle function. To date, there is no dataset for automatic computer vision detection of these structures, despite computer vision being well poised to standardize and viably scale severity measurements. To address this, we present NEEDL-Bench, a dataset of 3250 annotated images from 1082 Douglas-fir needles, annotated for both keypoints and bounding-box detectors. This dataset exhibits a challenging collection of features, including blur, poor object contrast, small objects of interest, and occlusions. To better capture both the nominal distribution of the data and the full breadth of rare structures, we present two distinct evaluation splits: either random sampling from the collected images or sequential sampling to maximize structural diversity. We evaluate multiple popular keypoint and bounding box methods for detection on this dataset as a baseline and observe a maximum F1 score of 0.8479, suggesting significant potential for gains from future development on this problem. Further, we find that larger models generally do not show commensurate gains in performance on this dataset, indicating that improvements on this problem will not come from scaling laws but rather from domain-specific inductive biases.
- Abstract(参考訳): NEEDL-BenchはSwiss Needle Cast(SNC)の顕微鏡検出ベンチマークであり,ダグラス・ファー木の真菌症である。
ダグラス・ファー (Douglas-fir) は、軟材材資源として主要な生態学的・経済的重要性のキーストーンであり、SNCは、針のガス交換孔 (stomata) を通して現れる性生殖構造 (pseudothecia) を形成し、ガス交換を阻害し、針機能を改善することによって生産性に影響を与える。
現在、これらの構造のコンピュータビジョン自動検出のためのデータセットは存在しないが、コンピュータビジョンは厳密度測定の標準化と拡張に適している。
NEEDL-Benchは1082のDouglas-firの針から3250の注釈付き画像のデータセットであり、キーポイントとバウンディングボックスの両方に注釈付きである。
このデータセットは、ぼやけ、オブジェクトコントラストの貧弱、関心の小さなオブジェクト、オクルージョンなど、困難な機能のコレクションを表示する。
得られた画像からのランダムサンプリングと、構造多様性を最大化するためのシーケンシャルサンプリングの2つの異なる評価分割を提示する。
我々は、このデータセットをベースラインとして検出するための複数の一般的なキーポイントとバウンディングボックス法を評価し、最大F1スコアの0.8479を観測し、この問題に対する今後の発展の可能性が示唆された。
さらに、より大規模なモデルでは、一般的にこのデータセットの性能向上は見られず、この問題の改善は法則のスケーリングではなく、ドメイン固有の帰納バイアスによるものであることを示唆している。
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