論文の概要: GRAIN: Molecules Are Not the Right Granularity -- Active-Ingredient Modeling for Safe Medication Recommendation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2608.00098v1
- Date: Thu, 30 Jul 2026 18:13:30 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-08-04 21:56:46.35448
- Title: GRAIN: Molecules Are Not the Right Granularity -- Active-Ingredient Modeling for Safe Medication Recommendation
- Title(参考訳): GRAIN: 分子は正しい粒度ではない -- 安全な医療勧告のためのアクティブ・イングレディエント・モデリング
- Abstract要約: 電子健康記録からの薬剤の推奨は、多薬効下での有害薬物・薬物相互作用(DDI)のリスクに対する予測精度のバランスをとる必要がある。
有効成分は、粒度の不足であり、その周辺に構築された医薬品推奨フレームワークであるGRAINを導入している。
GRAINは、長い不規則な訪問シーケンスを線形時間で処理する選択的な状態空間バックボーンで、縦方向の患者軌跡(診断、手順、過去の薬品)を符号化する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.26215287738502
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Medication recommendation from electronic health records must balance predictive accuracy against the risk of adverse drug-drug interactions (DDIs) under polypharmacy. Existing safety-aware recommenders operate at one of two granularities: the drug code, which treats each medication as an indivisible token, or the molecular substructure, which is finer than pharmacological interaction knowledge is actually organized. We argue that the active ingredient is the missing granularity, and introduce GRAIN, a medication recommendation framework built around it. GRAIN encodes longitudinal patient trajectories (diagnoses, procedures, past medications) with a selective state space backbone that handles long, irregular visit sequences in linear time. On top of it we introduce a joint objective unifying three knowledge sources aligned to a common medication vocabulary: a drug-level DDI graph, an ingredient-level DDI graph obtained by normalizing medication codes to active ingredients via RxNorm, and an EHR-derived co-prescription graph. A proportional controller adapts the accuracy-safety trade-off to the observed validation DDI rate rather than fixing it a priori. Under strictly matched settings -- identical preprocessing, cohort, vocabulary, split, and evaluation code -- GRAIN improves over a re-implemented MambaHealth baseline on MIMIC-IV across all standard multi-label metrics (Jaccard 0.4488 to 0.4983, PRAUC 0.6911 to 0.7485, F1 0.5989 to 0.6453) while reducing the drug-level DDI rate from 0.1875 to 0.0948. We further define an ingredient-level DDI rate, a safety measure invisible to drug-code-level evaluation. The results indicate that ingredient-level normalization recovers predictive signal erased by code-level aggregation, and that it is complementary to, rather than in competition with, accurate sequence modeling.
- Abstract(参考訳): 電子健康記録からの薬剤の推奨は、多薬効下での有害薬物・薬物相互作用(DDI)のリスクに対する予測精度のバランスをとる必要がある。
既存のセーフティ・アウェア・レコメンデーターは、2つの粒度のうちの1つで作用する:各薬剤を識別不能なトークンとして扱う薬物コード、または薬理学的相互作用の知識よりも微細な分子サブ構造が実際に組織化されている。
有効成分は、粒度の不足であり、その周辺に構築された医薬品推奨フレームワークであるGRAINを導入している。
GRAINは、長い不規則な訪問シーケンスを線形時間で処理する選択的な状態空間バックボーンで、縦方向の患者軌跡(診断、手順、過去の薬品)を符号化する。
薬物レベルDDIグラフ,RxNormによる有効成分の正常化により得られた成分レベルDDIグラフ,ERH由来の共処方グラフの3つの知識ソースを統一する共同目的について紹介する。
比例制御器は、プリオリを固定するのではなく、観測された検証DDIレートに精度安全トレードオフを適用する。
厳密にマッチした設定 -- 同一の前処理、コホート、語彙、分割、評価コード -- の下で、GRAINはMIMIC-IV上の再実装されたMambaHealthベースライン(Jaccard 0.4488から0.4983、PRAUC 0.6911から0.7485、F1 0.5989から0.6453)を改良し、薬物レベルのDDIレートを0.1875から0.0948に下げる。
さらに, 成分レベルDDI率, 薬剤コードレベルの評価には見えない安全性指標を定義した。
その結果, 成分レベルの正規化は, コードレベルのアグリゲーションによって消去された予測信号を復元し, 正確なシーケンスモデリングと競合するのではなく, 相補的であることを示唆した。
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