論文の概要: Neuro-Evolved Heuristics for Variable Gapped Common Subsequence Identification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2608.00888v1
- Date: Sat, 01 Aug 2026 22:36:35 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-08-04 15:07:24.981041
- Title: Neuro-Evolved Heuristics for Variable Gapped Common Subsequence Identification
- Title(参考訳): 可変Gapped Common Subsequence Identificationのための神経進化型ヒューリスティックス
- Abstract要約: 本研究は,可変Gapped Longest Common Subsequence Problem (VGLCSP)に対処する。
VGLCSP (VGLCSP) は、古典的最長の共通部分列問題の変種である。
より効果的なデータ駆動ロバストネスを自動設計するための学習に基づくアプローチを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 40.920500181764986
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: This study addresses the Variable Gapped Longest Common Subsequence Problem (VGLCSP), a variant of the classical longest common subsequence problem with additional gap constraints and applications in sequence alignment and time-series analysis. While the two-sequence version has been widely studied using dynamic programming, the generalized multi-sequence form is usually solved with beam search-based heuristics, whose hand-crafted designs often lack robustness. To overcome this limitation, we propose a learning-based approach for automatically designing more effective data-driven heuristics. The heuristics are represented by a neural network with predefined architecture, whose weights are optimized by a genetic algorithm within a neuro-evolutionary framework. The learning process alternates between weight optimization and evaluation within an iterative multi-source beam search procedure, a state-of-the-art method for the problem. Rather than constructing solutions directly, the neural network learns to guide the search process, producing a neuro-evolved heuristic. We further introduce an ensemble heuristic that combines the scores of learned and the best-performing hand-crafted heuristic. Integrated into the iterative multi-source beam search framework, the resulting hybrid approach outperforms existing methods on both synthetic benchmark instances and newly introduced real-world instances with data-driven gap constraints.
- Abstract(参考訳): 本研究は,古典的長期共通部分列問題の変種である可変Gapped Longest Common Subsequence Problem (VGLCSP) について検討する。
2列型は動的プログラミングを用いて広く研究されているが、一般化された多列型は通常ビームサーチに基づくヒューリスティックで解決される。
この制限を克服するために、より効果的なデータ駆動ヒューリスティックを自動設計するための学習ベースのアプローチを提案する。
ヒューリスティックは事前に定義されたアーキテクチャを持つニューラルネットワークによって表現され、その重みは神経進化フレームワーク内の遺伝的アルゴリズムによって最適化される。
学習プロセスは、反復的マルチソースビーム探索手順における重み付け最適化と評価を交互に行う。
ニューラルネットワークは、ソリューションを直接構築するのではなく、探索プロセスのガイドを学び、神経進化したヒューリスティックを生成する。
さらに、学習のスコアと最も優れた手作りのヒューリスティックを組み合わせたアンサンブルヒューリスティックを導入する。
反復的マルチソースビームサーチフレームワークに統合され、結果として得られたハイブリッドアプローチは、合成ベンチマークインスタンスと、データ駆動ギャップ制約を備えた新しく導入された実世界のインスタンスの両方において、既存のメソッドよりも優れている。
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