論文の概要: RamanPFN: learning from Raman spectral structure with a tabular foundation model
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2608.02157v1
- Date: Mon, 03 Aug 2026 12:37:55 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-08-04 15:07:25.566247
- Title: RamanPFN: learning from Raman spectral structure with a tabular foundation model
- Title(参考訳): RamanPFN:表層基礎モデルを用いたRamanスペクトル構造からの学習
- Abstract要約: ラマン分光法は、材料科学、バイオメディシン、プロセスモニタリングにまたがる非破壊的でラベルのない分子特性を可能にする。
予測ラマンデータセットには、ラベル付きスペクトルがほとんどなく、数千の順序の波数が含まれていることが多い。
本稿では、TabPFNの推論の前に依存関係を符号化するスペクトル表現フレームワークであるRamanPFNを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.156304764307903
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Raman spectroscopy enables non-destructive, label-free molecular characterization across materials science, biomedicine and process monitoring. Predictive Raman datasets often contain few labelled spectra and thousands of ordered wavenumbers, with informative variation within bands and across distant spectral regions. Latent-variable chemometrics accommodates collinear small-sample data but can obscure fine peak morphology, whereas deep spectral networks resolve this structure only after task-specific training. TabPFN avoids task-specific parameter fitting through pretrained in-context inference, but processes very wide inputs as feature-subsampled views that do not preserve joint visibility of related bands. We present RamanPFN, a spectral representation framework that encodes these dependencies before TabPFN inference. Global Compositional Unmixing constructs non-negative coordinates over the complete spectrum so that distant bands with shared latent variation occupy a common predictive axis. Local Vibrational Subspace Encoding represents contiguous wavenumber regions with multiple orthogonal modes that retain independent changes in peak shape, intensity and position. The representations are evaluated separately and combined at the prediction level. Evaluation covered 150 tasks from 74 public Raman datasets. RamanPFN reduced root-mean-square error by 19.6% on average across 129 regression targets relative to direct TabPFN inference and further reduced the remaining classification error by 9.0% across 21 classification tasks. These results establish explicit spectral representation as an effective interface between high-dimensional Raman measurements and reusable tabular inference.
- Abstract(参考訳): ラマン分光法は、材料科学、バイオメディシン、プロセスモニタリングにまたがる非破壊的でラベルのない分子特性を可能にする。
予測ラマンデータセットにはラベル付きスペクトルがほとんどなく、数千の順序の波数が含まれており、帯域内や遠方のスペクトル領域に情報的変化がある。
潜時変量ケモメトリはコリニアの小さなサンプルデータに対応しているが、深いスペクトルネットワークはタスク固有の訓練後にのみこの構造を解決している。
TabPFNは、事前訓練されたインコンテキスト推論によるタスク固有のパラメータのフィッティングを避けるが、非常に広い範囲の入力を、関連するバンドのジョイント可視性を保たない特徴サブサンプルビューとして処理する。
本稿では、これらの依存関係をTabPFN推論の前に符号化するスペクトル表現フレームワークであるRamanPFNを提案する。
グローバルな構成的アンミックスは、完全スペクトル上の非負の座標を構成するので、共分散潜時変動を持つ遠方のバンドが共通の予測軸を占める。
局所振動部分空間符号化は、ピーク形状、強度、位置の独立的な変化を保持する複数の直交モードを持つ連続波数領域を表す。
表現は別々に評価され、予測レベルで組み合わせられる。
評価では、74の公開Ramanデータセットから150のタスクをカバーした。
RamanPFNは、直接のTabPFN推論と比較して129の回帰目標に対して平均して、ルート平均二乗誤差を19.6%削減し、残りの分類誤差を21の分類タスクで9.0%削減した。
これらの結果は,高次元ラマン測度と再利用可能な表層推論との効果的なインターフェースとして,明示的なスペクトル表現を確立した。
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