論文の概要: PatTree: a novel approach for automated creation of multimodal, graph-based patient representations for medical classification tasks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2608.02692v1
- Date: Mon, 03 Aug 2026 09:44:35 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-08-05 15:30:22.899758
- Title: PatTree: a novel approach for automated creation of multimodal, graph-based patient representations for medical classification tasks
- Title(参考訳): PatTree: 医療分類タスクのためのマルチモーダルグラフベースの患者表現の自動作成のための新しいアプローチ
- Abstract要約: PatTreeは、実際の臨床データから得られるグラフベースの患者の表現である。
本稿では,PatTreeによる患者の分類が,最先端の分類性能に到達できることを実証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.13999481573773073
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Access to holistic, multimodal data improves the performance of Artificial Intelligence (AI) in medical classification tasks compared to utilizing single modalities or data sources. However, the inherent heterogeneity and complexity of clinical real-world data pose significant challenges to structured data analysis and AI application. This heterogeneity includes missing values, multiple time points, diverse modalities, and inconsistent formats and semantics. Data harmonization prior to data integration tackles this challenge but remains resource-intensive and error-prone, limiting the scalability and reproducibility of holistic, AI-driven decision support on clinical real-world data. We therefore propose PatTree, a graph-based, holistic representation of patients that can be derived from real-world clinical data through the automated structuring of multimodal clinical data. PatTree enables early-stage data integration without relying on pre-standardized inputs. While representing heterogeneous clinical data within a unified knowledge graph, PatTree preserves the semantic relationships between data elements across modalities and data sources, facilitating interoperability and machine-interpretable data access. Using a subset of the ADNI-1 cohort (n = 763), we demonstrate that classification of patients is directly feasible on PatTree reaching state-of-the-art classification performance. In the three-class classification task distinguishing Alzheimer's disease, mild cognitive impairment, and cognitively normal individuals, we achieve a balanced accuracy of 98.5% and an F$_1$ score of 0.987 on the held-out test set. Our results show that assumption-free, automated structuring of multimodal medical data can serve as a scalable foundation for clinical AI pipelines bypassing tedious data preparation and standardization.
- Abstract(参考訳): 総合的なマルチモーダルデータへのアクセスは、単一のモダリティやデータソースを使用するよりも、医療分類タスクにおける人工知能(AI)の性能を向上させる。
しかし、臨床実世界のデータの本質的な不均一性と複雑さは、構造化データ分析とAI応用に重大な課題をもたらす。
この不均一性には、欠落した値、複数の時間点、多様なモダリティ、一貫性のないフォーマットとセマンティクスが含まれる。
データ統合前のデータ調和は、この課題に対処するが、リソース集約的でエラーを起こし、臨床現実のデータに対する総合的でAI駆動の意思決定サポートのスケーラビリティと再現性を制限している。
そこで我々は,マルチモーダルな臨床データの自動構造化を通じて実世界の臨床データから導出可能な,グラフに基づく総合的な患者表現であるPatTreeを提案する。
PatTreeは、事前の標準入力に頼ることなく、アーリーステージのデータ統合を可能にする。
PatTreeは、統一知識グラフ内で異種の臨床データを表現しながら、モダリティとデータソースをまたいだデータ要素間のセマンティックな関係を保ち、相互運用性とマシンで解釈可能なデータアクセスを容易にする。
ADNI-1コホートのサブセット(n = 763)を用いて,PatTreeによる患者の分類が最先端の分類性能に到達できることを実証した。
アルツハイマー病,軽度認知障害,認知正常な個人を区別する3段階の分類課題において,評価基準値が98.5%,F$_1$スコアが0.987であった。
以上の結果から,マルチモーダル医療データの仮定のない自動構造化は,退屈なデータ作成と標準化を回避して,臨床AIパイプラインのスケーラブルな基盤となる可能性が示唆された。
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