論文の概要: Retrieval-Augmented Vision Foundation Models for Robust Leukemia Cell Classification across Multiple Microscopy Datasets
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2608.10657v1
- Date: Tue, 11 Aug 2026 08:39:16 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-08-12 19:14:45.963854
- Title: Retrieval-Augmented Vision Foundation Models for Robust Leukemia Cell Classification across Multiple Microscopy Datasets
- Title(参考訳): 複数の顕微鏡データを用いたロバスト白血病細胞分類のための検索補助視覚基盤モデル
- Abstract要約: 白血病細胞画像分類は、取得、染色、照明、サイトプロトコルから実際の領域へのシフトによって挑戦される。
この研究は、事前訓練された視覚基盤モデルを持つ2段階パイプラインを用いて、複数の異種データセットにわたる白血病分類のための堅牢なフレームワークを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.6999740786886535
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Leukemia cell image classification is challenged by real-world domain shifts from acquisition, staining, illumination, and site protocols, causing single-dataset models to generalize poorly in real clinical scenarios. This work presents a robust framework for leukemia classification across multiple heterogeneous datasets using a two-stage pipeline with a pretrained vision foundation model. Stage 1 performs binary classification (leukemia vs. non-leukemia) and is trained using 122,167 single-cell images. Stage 2 is conditionally applied to Stage 1 positives to perform subtype classification into Acute Lymphoblastic Leukemia (ALL) and Acute Myeloid Leukemia (AML), trained using 69,400 single-cell images. Labels are harmonized across five heterogeneous datasets to enable cross-dataset training, and performance is evaluated on a held-out dataset protocol to assess domain-shift generalization. Within this pipeline, three encoders are benchmarked (DinoBloom, pretrained on single-cell images; BiomedCLIP, pretrained on biomedical data; and CLIP as a general-purpose model) under linear probing, Low-Rank Adaptation (LoRA), and a Retrieval-Augmented Classification (RAC) module that retrieves the top-k most similar cell images to provide cytomorphological grounding. The objective is to quantify how much domain-specific pretraining contributes to performance under domain shift, and whether cost-effective adaptation and retrieval can be a viable alternative to expensive domain-specialized pretraining. The held-out protocol additionally serves as a diagnostic tool, revealing when classification performance is attributable to dataset-specific artifacts rather than to cytomorphological features.
- Abstract(参考訳): 白血病細胞画像分類は、取得、染色、照明、サイトプロトコルから現実のドメインシフトによって挑戦され、単一のデータセットモデルが実際の臨床シナリオで不十分な一般化を引き起こす。
この研究は、事前訓練された視覚基盤モデルを持つ2段階パイプラインを用いて、複数の異種データセットにわたる白血病分類のための堅牢なフレームワークを示す。
ステージ1は二分分類(白血病対非白血病)を行い、122,167個の単細胞画像を用いて訓練される。
急性リンパ性白血病 (ALL) と急性骨髄性白血病 (AML) の亜型分類を69,400枚の単細胞画像を用いて行った。
ラベルは、クロスデータセットトレーニングを可能にするために、5つの異種データセット間で調和し、保持されたデータセットプロトコル上でパフォーマンスを評価し、ドメインシフトの一般化を評価する。
このパイプライン内では、3つのエンコーダ(DinoBloom、単細胞画像で事前訓練されたバイオメディカルデータで事前訓練されたBiomedCLIP、汎用モデルとしてCLIP)を線形プローブ下でベンチマークし、ローランク適応(LoRA)とレトリーヴァル・拡張分類(RAC)モジュールで細胞形態学的基盤を提供する。
この目的は、ドメイン固有の事前訓練がドメインシフト時のパフォーマンスにどの程度貢献するかを定量化し、コスト効率の良い適応と検索が高価なドメイン特化事前訓練の代替となるかどうかを定量化することである。
さらに、ホールドアウトプロトコルは診断ツールとして機能し、分類性能が細胞形態学的な特徴よりもデータセット固有のアーティファクトに起因することを明らかにする。
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