論文の概要: Lymphocyte Mimicry Correction via Region-Level Tissue Reasoning and Unbalanced Optimal Transport
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2608.17151v1
- Date: Mon, 17 Aug 2026 21:33:55 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-08-19 21:40:53.136349
- Title: Lymphocyte Mimicry Correction via Region-Level Tissue Reasoning and Unbalanced Optimal Transport
- Title(参考訳): 局所レベル組織共鳴と不均衡輸送によるリンパ球ミトコンドリアの補正
- Authors: Xiang Li, Yuqi Wang, Casey C. Heirman, Jihye Heo, Kyle J. Lafata,
- Abstract要約: Loki-OTは、アンバランスド最適輸送を介して、個々の細胞予測を推論する領域レベルの組織を伝播する。
本報告では,未平衡最適輸送を用いた細胞レベルでの細胞レベルでの予測を伝播するLoki-OTについて述べる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.155460255030298
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Cell mimicry arises when different cell types appear morphologically similar. Human pathologists resolve this ambiguity using surrounding tissue context, whereas current vision models either lack contextual reasoning (cell foundation models) or cannot operate at the cell level (pathology MLLMs). We present Loki-OT, which propagates region-level tissue reasoning to individual cell predictions via Unbalanced Optimal Transport, using MLLM-derived density priors as soft guidance for ambiguous cell reassignment. Loki-OT is motivated by the observation that pretrained cell foundation model features already encode discriminative information, including tissue context, but standard cell-level supervision fails to use tissue context effectively. The resulting transport plan is distilled into a lightweight student MLP classifier that learns context-aware decision boundaries within the pretrained feature space. On the independent TCGA-BRCA cohort, Loki-OT achieved lower patient-level MAE than the fully supervised in-domain PanopTILs classifier and improved F1 in epithelium-rich mimicry tissues, using 278 weak region-level MLLM estimates built on a general-domain cell foundation model. Code: https://github.com/xiangli980/Lymphocyte_Mimicry_Correction_via_Loki_OT
- Abstract(参考訳): 細胞の模倣は、異なる細胞タイプが形態学的に類似しているときに起こる。
人間の病理学者はこの曖昧さを周囲の組織コンテキストを用いて解決する一方、現在の視覚モデルは文脈的推論(細胞基盤モデル)を欠いているか、細胞レベルでの操作ができない(病理学MLLM)。
本報告では, MLLM由来の密度前駆体をソフトガイダンスとして用い, 非平衡最適輸送による個々の細胞予測に影響を及ぼす領域レベルの組織を伝播させるロキ-OTについて述べる。
Loki-OTは、事前訓練された細胞基盤モデルが既に組織コンテキストを含む識別情報をコード化しているが、標準的な細胞レベルの監督は組織コンテキストを効果的に利用できないという観察に動機づけられている。
得られた輸送計画は、事前訓練された特徴空間内の文脈認識決定境界を学習する軽量の学生MLP分類器に蒸留される。
独立したTCGA-BRCAコホートでは、Loki-OTは、一般ドメイン細胞基盤モデル上に構築された278の弱い領域レベルのMLLM推定を用いて、完全に制御されたドメイン内PanopTILs分類器よりも低い患者レベルMAEを達成し、上皮に富んだ模倣組織においてF1を改善した。
コード:https://github.com/xiangli980/Lymphocyte_Mimicry_Correction_via_Loki_OT
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