論文の概要: Whole-Slide Image Analysis under Realistic Few-Shot Annotation Protocols
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2608.30420v1
- Date: Mon, 31 Aug 2026 08:17:44 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-09-01 18:31:31.304471
- Title: Whole-Slide Image Analysis under Realistic Few-Shot Annotation Protocols
- Title(参考訳): 実写Few-Shotアノテーションプロトコルによる全スライディング画像解析
- Abstract要約: 本研究では,空間的および生物学的な手がかりを組み合わせ,条件付きランダムフィールドを全スライド画像に適用するSlideCRFを提案する。
また,空間的局所的なクリックとスクリブルに基づく,現実的なアノテーションプロトコルのセットも提供する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 19.724558192829093
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Automating the analysis of whole-slide images has high clinical value, since characterizing cancers requires examining them in detail. Such analysis increasingly relies on vision-language models that provide patch-level zero-shot predictions. However, these predictions remain noisy and must be refined with a few annotations. A promising paradigm for this refinement is few-shot transduction. Rather than treating each patch independently, these methods leverage the relations between patches, together with a few annotations, to refine all predictions jointly. However, current transductive methods are evaluated under conditions that overlook key properties of whole-slide images: (i) datasets consist of independent patches extracted from multiple slides, ignoring the complex tissue organization; (ii) datasets are mostly balanced, whereas a single whole-slide image exhibits severe class imbalance, with several classes absent; and (iii) annotations are sampled at random, without reflecting how a pathologist annotates a limited number of regions. To align the transduction paradigm to realistic whole-slide settings, we introduce the following contributions. First, we propose SlideCRF, which adapts conditional random fields for whole-slide images by combining spatial and biological cues while accounting for classes that may be absent from a given slide. Second, we provide a set of realistic annotation protocols, based on spatially localized clicks and scribbles, modeling different pathologist interactions, such as the iterative correction of model errors. Across four datasets, we show that SlideCRF outperforms current transductive methods in macro F1, improving over the zero-shot predictions by +24.2% and +37.5% with one and 16 clicks per present class, respectively.
- Abstract(参考訳): がんの特徴付けには詳細な検査が必要であるため,全スライディング画像の解析の自動化は臨床的価値が高い。
このような分析は、パッチレベルのゼロショット予測を提供する視覚言語モデルにますます依存している。
しかし、これらの予測はうるさいままであり、いくつかのアノテーションで洗練されなければならない。
この改良のための有望なパラダイムは、数発のトランスダクションである。
それぞれのパッチを個別に扱うのではなく、パッチ間の関係をいくつかのアノテーションとともに利用して、すべての予測を共同で洗練する。
しかし、現在のトランスダクティブ法は、全スライディング画像のキー特性を見落としている条件下で評価される。
一 複雑な組織組織を無視して、複数のスライドから抽出した独立したパッチからなるデータセット
(ii)データセットは概ねバランスが取れているのに対し、単一のスライディング画像は深刻なクラス不均衡を示し、いくつかのクラスが欠落している。
(iii)アノテーションは、病理学者が限られた数の領域にアノテートする方法を反映することなく、ランダムにサンプリングされる。
トランスダクションのパラダイムを現実的な全スライド設定に整合させるため、以下のコントリビューションを紹介する。
まず,任意のスライドから欠落する可能性のあるクラスを考慮に入れながら,空間的および生物学的な手がかりを組み合わせることで,全スライド画像に対して条件付きランダムフィールドを適用するSlideCRFを提案する。
第2に、空間的局所的なクリックとスクリブルに基づいて、モデルエラーの反復的修正などの異なる病理学相互作用をモデル化する、現実的なアノテーションプロトコルのセットを提供する。
4つのデータセットで、SlideCRFはマクロF1における現在のトランスダクティブメソッドよりも優れており、ゼロショットの予測は+24.2%、+37.5%向上し、各クラスは1クリック16クリックとなっている。
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