論文の概要: DoAtlas-2: A Foundation for Self-Evolving Causal Biomedical Discovery
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2609.35107v1
- Date: Mon, 28 Sep 2026 13:13:01 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-02 16:56:26.857759
- Title: DoAtlas-2: A Foundation for Self-Evolving Causal Biomedical Discovery
- Title（参考訳）: DoAtlas-2: 自己進化型因果バイオメディカルディスカバリの基礎
- Abstract要約: DoAtlas-2は、自己進化する因果バイオメディカル発見の基礎である。
48カ国で720,000人以上の参加者をカバーする711の研究資源を統合している。
DoAtlas-2は、エビデンスギャップと未解決のメカニズムから研究問題を自律的に定式化する。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 27.735907470141317
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We introduce DoAtlas-2, a foundation for self-evolving causal biomedical discovery that organizes knowledge around causal mechanisms and advances through external evidence from human populations. DoAtlas-2 integrates 771 research resources covering more than 720,000 participants in 48 countries, from longitudinal clinical phenotypes, medical imaging, and continuous physiological signals to eight molecular layers, together with an evidence network of approximately 4.7 million literature-derived records over 93,566 concepts and 149,383 candidate causal relations. DoAtlas-2 autonomously formulates research questions from evidence gaps and unresolved mechanisms, prespecifies their causal designs, and generates validated analyses. Supporting, challenging, and unresolved results continuously revise mechanistic interpretations, the causal evidence state, and the discovery frontier, so that DoAtlas-2 self-evolves within a closed loop of hypothesis generation, empirical testing, and renewed discovery. DoAtlas-2 has systematically evaluated 2,031 research questions. In the Human Phenotype Project (HPP), it formulated 4,014 candidate pathway questions across vascular, early-glycemic, and hepatic-metabolic systems, and screening of the first 1,079 yielded statistical support for 756. Representative studies identify blood pressure as a convergence node linking adiposity, hepatic, and lipid phenotypes to vascular outcomes, and show that an adiposity-inflammation-blood-pressure pathway is largely attenuated by joint adjustment for body mass index (BMI) and smoking. The discovered vascular network constitutes a completely interpretable predictive foundation, admitting exact attribution of every prediction and closed-form mediation effects. DoAtlas-2 thereby unifies causal mechanism discovery, population-evidence testing, and interpretable prediction within one continuously evolving foundation.
- Abstract（参考訳）: 因果的メカニズムに関する知識を整理し,人間集団の外部的証拠を通じて進歩する,因果的生医学的発見の自己進化基盤であるDoAtlas-2を紹介する。
DoAtlas-2は、48か国720,000人以上の参加者をカバーし、縦断的な臨床表現型、医用画像、連続的な生理的信号から8つの分子層まで、そして93,566以上の文献由来の記録と149,383の因果関係のエビデンスネットワークを統合している。
DoAtlas-2は、エビデンスギャップと未解決のメカニズムから研究質問を自律的に定式化し、因果設計を規定し、検証された分析を生成する。
機械的解釈、因果的証拠状態、発見フロンティアを継続的に修正し、DoAtlas-2は仮説生成、経験的テスト、再発見の閉ループ内で自己進化する。
DoAtlas-2は、2,031の研究質問を体系的に評価している。
Human Phenotype Project (HPP)では、血管系、早期血糖、肝代謝系の4,014の候補経路を定式化した。
代表的な研究では、血圧は、アディポシティー、肝、脂質の表現型を血管系の結果に結びつける収束ノードとして同定し、アディポシティー・炎症・血圧経路は、BMIと喫煙の協調調整によって大きく減衰していることを示す。
発見された血管ネットワークは完全に解釈可能な予測基盤を構成し、全ての予測とクローズドフォームメディエーション効果の正確な帰属を認めている。
DoAtlas-2は、因果機構の発見、集団証拠検査、解釈可能な予測を、1つの継続的な進化基盤内で統合する。
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