論文の概要: HADRec: A Hierarchy-Aware Drug Recommendation Framework by Fusing Molecular Knowledge and Electronic Health Record
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.00984v1
- Date: Thu, 01 Oct 2026 03:20:54 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-03 01:19:23.877564
- Title: HADRec: A Hierarchy-Aware Drug Recommendation Framework by Fusing Molecular Knowledge and Electronic Health Record
- Title(参考訳): 分子知識と電子健康記録を融合した階層型医薬品推薦フレームワークHADRec
- Abstract要約: HADRecは、分子知識と電子健康記録を統合する階層型医薬品勧告フレームワークである。
Jaccard、F1、PR-AUCで最先端のパフォーマンスを実現している。
これらの結果は、HADRecを、安全で信頼性の高いAI駆動の医薬品推奨への高性能、解釈可能、臨床に根ざした経路として確立する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 15.092790142993188
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Accurate medication recommendation is central to clinical decision-making, directly determining therapeutic efficacy and patient safety. However, existing methods suffer from two key limitations: drugs are often abstracted as discrete tokens, ignoring their molecular structures and pharmacological mechanisms, and the commonly used "flat" recommendation paradigm fails to leverage the hierarchical logic of the internationally standardized Anatomical Therapeutic Chemical (ATC) classification system. To address these issues, we propose HADRec, a Hierarchy-Aware Drug Recommendation framework that integrates molecular knowledge with electronic health records (EHRs). HADRec employs LLaMA-7B to encode clinical notes for rich patient representations and ChemBERTa to encode drug Simplified Molecular Input Line Entry System strings, building a global molecular knowledge base. A cross-attention mechanism then performs deep multimodal fusion between patient states and drug features. The framework further incorporates a hierarchical predictor and a novel consistency constraint loss to enforce strict adherence to ATC logical dependencies. Extensive experiments on MIMIC-III demonstrate that HADRec achieves state-of-the-art performance across Jaccard, F1, and PR-AUC. External validation on MIMIC-IV confirms strong generalization under distribution shifts, and calibration analysis shows well-calibrated predictive confidence on MIMIC-IV with ECE = 0.04, and Brier = 0.06. Counterfactual evaluation reveals clinically aligned reasoning, disentangling disease-specific treatments from general care. Together, these results establish HADRec as a high-performance, interpretable, and clinically grounded pathway toward safe and reliable AI-driven medication recommendation.
- Abstract(参考訳): 正確な薬剤推奨は、治療効果と患者の安全性を直接判定する、臨床的意思決定の中心である。
しかしながら、既存の方法には2つの重要な制限がある: 薬は、しばしば離散トークンとして抽象化され、分子構造や薬理学的メカニズムを無視し、一般的に使用される「フラット」推奨パラダイムは、国際的に標準化された解剖学的治療化学(ATC)分類システムの階層論理を活用できない。
これらの課題に対処するため,分子知識と電子健康記録(EHR)を統合する階層型医薬品勧告フレームワークHADRecを提案する。
HADRecはLLaMA-7Bを用いて、リッチな患者表現のための臨床ノートをエンコードし、ChemBERTaは、単純化された分子入力ライン入力システム文字列をエンコードし、グローバルな分子知識基盤を構築する。
次に、クロスアテンション機構は、患者の状態と薬物の特徴との間の深いマルチモーダル融合を行う。
このフレームワークはさらに、階層的予測器と新しい一貫性制約損失を組み込んで、ATC論理的依存関係の厳格な遵守を強制する。
MIMIC-IIIの大規模な実験は、HADRecがJaccard、F1、PR-AUCをまたいで最先端のパフォーマンスを達成することを示した。
MIMIC-IVの外部検証は、分布シフトの下での強い一般化を確認し、キャリブレーション解析により、ECE = 0.04 と Brier = 0.06 でMIMIC-IVの精度の高い予測信頼度を示す。
臨床的に整合性があり、一般的な治療から疾患特異的な治療を遠ざけている。
これらの結果は、HADRecを、安全で信頼性の高いAI駆動の医薬品推奨へのハイパフォーマンス、解釈可能、臨床的に根拠付けられた経路として確立する。
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