論文の概要: Multimodal fusion of imaging and genomics for lung cancer recurrence
prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2002.01982v1
- Date: Wed, 5 Feb 2020 20:32:36 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-01-03 22:05:14.602245
- Title: Multimodal fusion of imaging and genomics for lung cancer recurrence
prediction
- Title(参考訳): 肺癌再発予測のための画像とゲノムのマルチモーダル融合
- Authors: Vaishnavi Subramanian, Minh N. Do, Tanveer Syeda-Mahmood
- Abstract要約: 肺癌は早期に再発率が高い。
線形コックス比例ハザードモデルを用いて, 弾性ネット正則化による再発予測の改善を実証した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.577999113548973
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Lung cancer has a high rate of recurrence in early-stage patients. Predicting
the post-surgical recurrence in lung cancer patients has traditionally been
approached using single modality information of genomics or radiology images.
We investigate the potential of multimodal fusion for this task. By combining
computed tomography (CT) images and genomics, we demonstrate improved
prediction of recurrence using linear Cox proportional hazards models with
elastic net regularization. We work on a recent non-small cell lung cancer
(NSCLC) radiogenomics dataset of 130 patients and observe an increase in
concordance-index values of up to 10%. Employing non-linear methods from the
neural network literature, such as multi-layer perceptrons and visual-question
answering fusion modules, did not improve performance consistently. This
indicates the need for larger multimodal datasets and fusion techniques better
adapted to this biological setting.
- Abstract(参考訳): 早期の肺癌は再発率が高い。
肺癌患者の術後再発の予測は伝統的にゲノム画像や放射線画像の単一のモダリティ情報を用いて行われている。
本課題におけるマルチモーダル融合の可能性について検討する。
また,ct画像とゲノミクスを組み合わせることで,線形cox比例ハザードモデルと弾性ネットの正則化による再発予測が向上することを示した。
我々は,130例の非小細胞肺癌(NSCLC)放射線ゲノミクスデータセットについて検討し,一致指数値の10%までの増加を観察した。
マルチ層パーセプトロンやビジュアルクエクション応答融合モジュールなど、ニューラルネットワークの文献から非線形メソッドを採用することは、パフォーマンスを一貫して改善することはなかった。
これは、より大規模なマルチモーダルデータセットと融合技術が必要であることを示している。
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