論文の概要: Longitudinal Pooling & Consistency Regularization to Model Disease
Progression from MRIs
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2003.13958v2
- Date: Wed, 26 May 2021 17:36:39 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-18 01:42:16.099467
- Title: Longitudinal Pooling & Consistency Regularization to Model Disease
Progression from MRIs
- Title(参考訳): MRIからのモデル疾患進展に対する経時的プール法と一貫性規則化
- Authors: Jiahong Ouyang, Qingyu Zhao, Edith V Sullivan, Adolf Pfefferbaum,
Susan F. Tapert, Ehsan Adeli, Kilian M Pohl
- Abstract要約: 本稿では,新しい縦型プール層に特徴抽出を結合させることにより,来訪者間の特徴を結合することを提案する。
アルツハイマー病神経画像イニシアチブ(ADNI)は,正常な274例とアルコール使用障害(AUD)329例からなる。
これら3つの実験において、我々の方法は、他の広く使われている縦断的分類法よりも優れているため、脳への条件の影響をより正確に追跡するのに一意に寄与する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.979581631288832
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Many neurological diseases are characterized by gradual deterioration of
brain structure and function. Large longitudinal MRI datasets have revealed
such deterioration, in part, by applying machine and deep learning to predict
diagnosis. A popular approach is to apply Convolutional Neural Networks (CNN)
to extract informative features from each visit of the longitudinal MRI and
then use those features to classify each visit via Recurrent Neural Networks
(RNNs). Such modeling neglects the progressive nature of the disease, which may
result in clinically implausible classifications across visits. To avoid this
issue, we propose to combine features across visits by coupling feature
extraction with a novel longitudinal pooling layer and enforce consistency of
the classification across visits in line with disease progression. We evaluate
the proposed method on the longitudinal structural MRIs from three neuroimaging
datasets: Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI, N=404), a dataset
composed of 274 normal controls and 329 patients with Alcohol Use Disorder
(AUD), and 255 youths from the National Consortium on Alcohol and
NeuroDevelopment in Adolescence (NCANDA). In all three experiments our method
is superior to other widely used approaches for longitudinal classification
thus making a unique contribution towards more accurate tracking of the impact
of conditions on the brain. The code is available at
https://github.com/ouyangjiahong/longitudinal-pooling.
- Abstract(参考訳): 多くの神経疾患は、徐々に脳の構造と機能の悪化によって特徴づけられる。
大規模なMRIデータセットでは、診断の予測に機械学習とディープラーニングを適用することで、そのような劣化が明らかにされている。
一般的なアプローチは、畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を使用して、縦方向MRIの各訪問から情報的特徴を抽出し、それらの特徴を使用して、リカレントニューラルネットワーク(RNN)を介して各訪問を分類することである。
このようなモデルでは疾患の進行性が無視され、臨床上は見当たらない分類になる可能性がある。
この問題を回避するため, 特徴抽出と新しい長手プール層を結合して, 来訪者間の特徴抽出を行い, 病状進行に伴う分類の整合性を確保することを提案する。
アルツハイマー病神経画像イニシアチブ (ADNI, N=404), 正常コントロール274例, アルコール使用障害329例, 若年者におけるアルコール・神経発達に関する全国コンソーシアム (NCANDA) の255名の若年者を対象とした。
3つの実験すべてにおいて,この手法は,他の広く用いられている縦断分類法よりも優れているため,脳への条件の影響をより正確に追跡する上で,ユニークな貢献をしている。
コードはhttps://github.com/ouyangjiahong/longitudinal-poolingで入手できる。
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