論文の概要: Recognizing Magnification Levels in Microscopic Snapshots
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2005.03748v1
- Date: Thu, 7 May 2020 20:48:29 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-05 23:41:57.679816
- Title: Recognizing Magnification Levels in Microscopic Snapshots
- Title(参考訳): 微視的スナップショットにおける拡大レベル認識
- Authors: Manit Zaveri, Shivam Kalra, Morteza Babaie, Sultaan Shah, Savvas
Damskinos, Hany Kashani, H.R. Tizhoosh
- Abstract要約: デジタルイメージングはコンピュータビジョンと機械学習を、病理画像を分析する新しいツールに変えた。
デジタル画像の最近の進歩は、コンピュータビジョンと機械学習を、病理画像を分析するための新しいツールに変えた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.6234848946076785
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Recent advances in digital imaging has transformed computer vision and
machine learning to new tools for analyzing pathology images. This trend could
automate some of the tasks in the diagnostic pathology and elevate the
pathologist workload. The final step of any cancer diagnosis procedure is
performed by the expert pathologist. These experts use microscopes with high
level of optical magnification to observe minute characteristics of the tissue
acquired through biopsy and fixed on glass slides. Switching between different
magnifications, and finding the magnification level at which they identify the
presence or absence of malignant tissues is important. As the majority of
pathologists still use light microscopy, compared to digital scanners, in many
instance a mounted camera on the microscope is used to capture snapshots from
significant field-of-views. Repositories of such snapshots usually do not
contain the magnification information. In this paper, we extract deep features
of the images available on TCGA dataset with known magnification to train a
classifier for magnification recognition. We compared the results with LBP, a
well-known handcrafted feature extraction method. The proposed approach
achieved a mean accuracy of 96% when a multi-layer perceptron was trained as a
classifier.
- Abstract(参考訳): デジタルイメージングの最近の進歩は、コンピュータビジョンと機械学習を、病理画像を分析する新しいツールに変えた。
この傾向は、診断病理学におけるいくつかのタスクを自動化し、病理医の作業量を増加させる可能性がある。
がん診断の最終段階は、専門家の病理医によって行われる。
これらの専門家は、高レベルの光学倍率顕微鏡を使用して、生検で得られた組織の微細な特性を観察し、ガラススライドに固定する。
異なる倍率の間を切り替え、悪性組織の有無を識別する倍率レベルを見つけることが重要である。
病理学者の大多数がデジタルスキャナーと比較して光顕微鏡を使っているため、多くの場合、顕微鏡に装着されたカメラは、重要な視野からのスナップショットをキャプチャするために使用される。
このようなスナップショットのリポジトリは通常、倍率情報を含まない。
本稿では,TCGAデータセットで利用可能な画像の深い特徴を抽出し,画像認識のための分類器を訓練する。
その結果,手作り特徴抽出法としてよく知られているlppと比較した。
提案手法は,多層パーセプトロンを分類器として訓練し,平均96%の精度を達成した。
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