論文の概要: Temporal Poisson Square Root Graphical Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2005.06462v1
- Date: Tue, 12 May 2020 22:49:45 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-03 18:33:28.415926
- Title: Temporal Poisson Square Root Graphical Models
- Title(参考訳): 時間ポアソン正方形のルート図形モデル
- Authors: Sinong Geng, Zhaobin Kuang, Peggy Peissig, David Page
- Abstract要約: 時系列イベントデータをモデル化するための時間的ポアソン平方根グラフモデル(TPSQR)を提案する。
TPSQRは、任意のイベントタイプの発生が他のタイプを興奮または抑制できるかどうかについて、全体的な視点を提供することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.220217498103311
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We propose temporal Poisson square root graphical models (TPSQRs), a
generalization of Poisson square root graphical models (PSQRs) specifically
designed for modeling longitudinal event data. By estimating the temporal
relationships for all possible pairs of event types, TPSQRs can offer a
holistic perspective about whether the occurrences of any given event type
could excite or inhibit any other type. A TPSQR is learned by estimating a
collection of interrelated PSQRs that share the same template parameterization.
These PSQRs are estimated jointly in a pseudo-likelihood fashion, where Poisson
pseudo-likelihood is used to approximate the original more
computationally-intensive pseudo-likelihood problem stemming from PSQRs.
Theoretically, we demonstrate that under mild assumptions, the Poisson
pseudo-likelihood approximation is sparsistent for recovering the underlying
PSQR. Empirically, we learn TPSQRs from Marshfield Clinic electronic health
records (EHRs) with millions of drug prescription and condition diagnosis
events, for adverse drug reaction (ADR) detection. Experimental results
demonstrate that the learned TPSQRs can recover ADR signals from the EHR
effectively and efficiently.
- Abstract(参考訳): 本稿では,時系列イベントデータをモデル化するための時間的ポアソン平方根グラフモデル(TPSQR)を提案する。
TPSQRは、あらゆる可能なイベントタイプの時間的関係を推定することにより、任意のイベントタイプの発生が他のタイプを興奮または阻害するかどうかについて、全体的な視点を提供することができる。
TPSQRは、同じテンプレートパラメータ化を共有する関連するPSQRの集合を推定することによって学習される。
これらのPSQRは、PSQRから生じるより計算集約的な擬似類似問題を近似するために、ポアソン擬似類似度を用いて、擬似類似度で推定される。
理論的には、軽微な仮定の下では、ポアソン擬似近似は基礎となるPSQRを回復するためにスパーシスタントであることが示される。
マーシュフィールド・クリニックの電子健康記録(EHR)から数百万の薬物処方薬と症状診断イベントを用いてTPSQRを学習し、副作用の薬物反応(ADR)を検出する。
実験の結果,学習したTPSQRsは,ERHからADR信号を効率よく回収できることがわかった。
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