論文の概要: Rapid tissue oxygenation mapping from snapshot structured-light images
with adversarial deep learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2007.00760v1
- Date: Wed, 1 Jul 2020 21:14:05 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-14 23:03:08.059969
- Title: Rapid tissue oxygenation mapping from snapshot structured-light images
with adversarial deep learning
- Title(参考訳): 逆深層学習を用いたスナップショット構造光画像からの高速組織酸素マッピング
- Authors: Mason T. Chen and Nicholas J. Durr
- Abstract要約: OxyGANは、単一構造光画像から直接組織酸素化を推定する内容認識法である。
交叉型OxyGANは、ヒトの足でテストした場合、96.5%の精度で組織酸素化をマッピングする。
OxyGANは、多くの臨床応用に有用なリアルタイム、高忠実な組織酸素マッピングを可能にする可能性がある。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.214866856754944
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Spatial frequency domain imaging (SFDI) is a powerful technique for mapping
tissue oxygen saturation over a wide field of view. However, current SFDI
methods either require a sequence of several images with different illumination
patterns or, in the case of single snapshot optical properties (SSOP),
introduce artifacts and sacrifice accuracy. To avoid this tradeoff, we
introduce OxyGAN: a data-driven, content-aware method to estimate tissue
oxygenation directly from single structured light images using end-to-end
generative adversarial networks. Conventional SFDI is used to obtain ground
truth tissue oxygenation maps for ex vivo human esophagi, in vivo hands and
feet, and an in vivo pig colon sample under 659 nm and 851 nm sinusoidal
illumination. We benchmark OxyGAN by comparing to SSOP and to a two-step hybrid
technique that uses a previously-developed deep learning model to predict
optical properties followed by a physical model to calculate tissue
oxygenation. When tested on human feet, a cross-validated OxyGAN maps tissue
oxygenation with an accuracy of 96.5%. When applied to sample types not
included in the training set, such as human hands and pig colon, OxyGAN
achieves a 93.0% accuracy, demonstrating robustness to various tissue types. On
average, OxyGAN outperforms SSOP and a hybrid model in estimating tissue
oxygenation by 24.9% and 24.7%, respectively. Lastly, we optimize OxyGAN
inference so that oxygenation maps are computed ~10 times faster than previous
work, enabling video-rate, 25Hz imaging. Due to its rapid acquisition and
processing speed, OxyGAN has the potential to enable real-time, high-fidelity
tissue oxygenation mapping that may be useful for many clinical applications.
- Abstract(参考訳): 空間周波数領域イメージング(SFDI)は、組織酸素飽和度を広い視野にマッピングする強力な技術である。
しかし、現在のsfdi法は、異なる照明パターンを持つ複数の画像のシーケンスを必要とするか、単一スナップショット光学特性(ssop)の場合、アーティファクトと犠牲精度をもたらす。
このトレードオフを回避するために、エンド・ツー・エンドのジェネレーティブな敵ネットワークを用いて、単一の構造化光画像から直接組織酸素化を推定するデータ駆動型コンテンツ認識手法であるoxyganを紹介する。
従来のsfdiは、in vivoのヒトエソファジ、in vivoの手で、そしてin vivoのブタの大腸サンプルの659 nmと851 nmの正弦波照明のための基底真理組織酸素化マップを得るのに使用される。
オキシガンをssopと比較し,従来開発してきた深層学習モデルを用いて光学特性を予測し,物理モデルを用いて組織酸素化を計算した2段階ハイブリッド手法と比較した。
ヒトの足で検査すると、OxyGANは96.5%の精度で組織酸素化をマッピングする。
人間の手やブタの大腸などトレーニングセットに含まれないサンプルタイプに適用すると、OxyGANは93.0%の精度で、様々な組織タイプに対して堅牢性を示す。
OxyGAN は平均して SSOP とハイブリッドモデルでそれぞれ 24.9% と 24.7% を推定している。
最後に、OxyGAN推論を最適化し、酸素化マップを従来よりも約10倍高速に計算し、ビデオレート、25Hzイメージングを可能にする。
迅速な取得と処理速度のため、OxyGANはリアルタイムで高忠実な組織酸素マッピングを可能にする可能性があり、多くの臨床応用に有用である。
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