論文の概要: Classification of Multiple Diseases on Body CT Scans using Weakly
Supervised Deep Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2008.01158v3
- Date: Wed, 17 Nov 2021 02:42:07 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-03 06:15:18.724839
- Title: Classification of Multiple Diseases on Body CT Scans using Weakly
Supervised Deep Learning
- Title(参考訳): 深層学習による全身CT画像上の多発性疾患の分類
- Authors: Fakrul Islam Tushar, Vincent M. D'Anniballe, Rui Hou, Maciej A.
Mazurowski, Wanyi Fu, Ehsan Samei, Geoffrey D. Rubin, Joseph Y. Lo
- Abstract要約: ルールベースのアルゴリズムを用いて、12,092人の患者から13,667体のCTスキャンから19,225の疾患ラベルを抽出した。
各臓器について、3次元の畳み込みニューラルネットワークは、全15のラベルで4つの共通疾患に対して明らかな疾患を分類しなかった。
結果: 抽出したラベルの手動検証により, 15種類のラベルで91%から99%の精度が確認された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.287303475865695
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Purpose: To design multi-disease classifiers for body CT scans for three
different organ systems using automatically extracted labels from radiology
text reports.Materials & Methods: This retrospective study included a total of
12,092 patients (mean age 57 +- 18; 6,172 women) for model development and
testing (from 2012-2017). Rule-based algorithms were used to extract 19,225
disease labels from 13,667 body CT scans from 12,092 patients. Using a
three-dimensional DenseVNet, three organ systems were segmented: lungs and
pleura; liver and gallbladder; and kidneys and ureters. For each organ, a
three-dimensional convolutional neural network classified no apparent disease
versus four common diseases for a total of 15 different labels across all three
models. Testing was performed on a subset of 2,158 CT volumes relative to 2,875
manually derived reference labels from 2133 patients (mean age 58 +- 18;1079
women). Performance was reported as receiver operating characteristic area
under the curve (AUC) with 95% confidence intervals by the DeLong method.
Results: Manual validation of the extracted labels confirmed 91% to 99%
accuracy across the 15 different labels. AUCs for lungs and pleura labels were:
atelectasis 0.77 (95% CI: 0.74, 0.81), nodule 0.65 (0.61, 0.69), emphysema 0.89
(0.86, 0.92), effusion 0.97 (0.96, 0.98), and no apparent disease 0.89 (0.87,
0.91). AUCs for liver and gallbladder were: hepatobiliary calcification 0.62
(95% CI: 0.56, 0.67), lesion 0.73 (0.69, 0.77), dilation 0.87 (0.84, 0.90),
fatty 0.89 (0.86, 0.92), and no apparent disease 0.82 (0.78, 0.85). AUCs for
kidneys and ureters were: stone 0.83 (95% CI: 0.79, 0.87), atrophy 0.92 (0.89,
0.94), lesion 0.68 (0.64, 0.72), cyst 0.70 (0.66, 0.73), and no apparent
disease 0.79 (0.75, 0.83). Conclusion: Weakly-supervised deep learning models
were able to classify diverse diseases in multiple organ systems.
- Abstract(参考訳): 目的: 放射線学のテキストレポートから自動的に抽出されたラベルを用いて, 3種類の臓器用CTスキャン用多剤分類器を設計するために, モデル開発と検査(2012~2017年)のために, 計12,092人(平均57+18, 6,172人)の患者を対象とした。
ルールベースのアルゴリズムを用いて、12,092人の患者から13,667体のCTスキャンから19,225の疾患ラベルを抽出した。
3次元DenseVNetを用いて肺と胸膜、肝臓と胆嚢、腎臓と尿管の3つの臓器系を分離した。
各臓器について、3次元畳み込みニューラルネットワークは、3つのモデルで合計15の異なるラベルで、明らかな疾患と4つの一般的な疾患を分類していない。
2133例(平均年齢58歳+-18;1079女性)の2,875例と比較して,2,158個のCTボリュームで試験を行った。
DeLong法により95%信頼区間を有する曲線(AUC)下での受信特性領域としての性能を報告した。
結果: 抽出ラベルの手動検証により、15の異なるラベルで91%から99%の精度が確認された。
Atelectasis 0.77 (95% CI: 0.74, 0.81), nodule 0.65 (0.61, 0.69), emphysema 0.89 (0.86, 0.92), effusion 0.97 (0.96, 0.98), no apparent disease 0.89 (0.87, 0.91)である。
肝胆道石灰化 0.62 (95% ci: 0.56, 0.67), 病変 0.73 (0.69, 0.77), 拡張 0.87 (0.84, 0.90), 脂肪 0.89 (0.86, 0.92), 明らかな疾患は 0.82 (0.78, 0.85) であった。
腎臓と尿管のAUCは、Stone 0.83 (95% CI: 0.79, 0.87), atrophy 0.92 (0.89, 0.94), lesion 0.68 (0.64, 0.72), cyst 0.70 (0.66, 0.73), and no apparent disease 0.79 (0.75, 0.83)である。
結論: 弱教師付き深層学習モデルは多臓器系において多様な疾患を分類することができた。
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